HLA-E

HLA-E
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 3CII, 1KPR, 1KTL, 1MHE, 2ESV, 3AM8, 3BZE, 3BZF, 3CDG
Ідентифікатори
Символи	HLA-E, EA1.2, EA2.1, HLA-6.2, MHC, QA1, major histocompatibility complex, class I, E
Зовнішні ІД	OMIM: 143010 MGI: 2442805 HomoloGene: 134018 GeneCards: HLA-E
Онтологія гена Молекулярна функція • beta-2-microglobulin binding • MHC class I protein binding • signaling receptor binding • natural killer cell lectin-like receptor binding • peptide antigen binding • T cell receptor binding Клітинна компонента • integral component of membrane • phagocytic vesicle membrane • early endosome membrane • мембрана • MHC class Ib protein complex • Golgi membrane • клітинна мембрана • cell surface • MHC class I protein complex • ER to Golgi transport vesicle membrane • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • екзосома • recycling endosome membrane Біологічний процес • antigen processing and presentation • адаптивна імунна відповідь • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • CD8-positive, alpha-beta T cell activation • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • positive regulation of T cell mediated cytotoxicity • positive regulation of TRAIL production • positive regulation of interleukin-4 production • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent • protection from natural killer cell mediated cytotoxicity • positive regulation of interleukin-13 production • type I interferon signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • regulation of natural killer cell mediated immunity • positive regulation of natural killer cell mediated immunity • regulation of immune response • positive regulation of tumor necrosis factor production • вроджений імунітет • positive regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell proliferation • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class Ib Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3133	667803
Ensembl	ENSG00000204592 ENSG00000225201 ENSG00000236632 ENSG00000230254 ENSG00000206493 ENSG00000233904 ENSG00000229252	ENSMUSG00000073405
UniProt	P13747	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_005516	NM_001271005
RefSeq (білок)	NP_005507	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 30.49 – 30.49 Mb	Хр. 17: 36.42 – 36.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HLA-E (англ. Major histocompatibility complex, class I, E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 358 амінокислот, а молекулярна маса — 40 157.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVDGTLLLLL		SEALALTQTW		AGSHSLKYFH		TSVSRPGRGE		PRFISVGYVD
DTQFVRFDND		AASPRMVPRA		PWMEQEGSEY		WDRETRSARD		TAQIFRVNLR
TLRGYYNQSE		AGSHTLQWMH		GCELGPDRRF		LRGYEQFAYD		GKDYLTLNED
LRSWTAVDTA		AQISEQKSND		ASEAEHQRAY		LEDTCVEWLH		KYLEKGKETL
LHLEPPKTHV		THHPISDHEA		TLRCWALGFY		PAEITLTWQQ		DGEGHTQDTE
LVETRPAGDG		TFQKWAAVVV		PSGEEQRYTC		HVQHEGLPEP		VTLRWKPASQ
PTIPIVGIIA		GLVLLGSVVS		GAVVAAVIWR		KKSSGGKGGS		YSKAEWSDSA
QGSESHSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ohya K., Kondo K., Mizuno S. (1990). Polymorphism in the human class I MHC locus HLA-E in Japanese. Immunogenetics. 32: 205—209. PMID 1977695 DOI:10.1007/BF02114975
• Mizuno S., Trapani J.A., Koller B.H., Dupont B., Yang S.Y. (1988). Isolation and nucleotide sequence of a cDNA clone encoding a novel HLA class I gene. J. Immunol. 140: 4024—4030. PMID 3131426
• Koller B.H., Geraghty D.E., Shimizu Y., Demars R., Orr H.T. (1988). HLA-E. A novel HLA class I gene expressed in resting T lymphocytes. J. Immunol. 141: 897—904. PMID 3260916

Див. також

• Хромосома 6