LBP

LBP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4M4D
Ідентифікатори
Символи	LBP, BPIFD2, lipopolysaccharide binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 151990 MGI: 1098776 HomoloGene: 3055 GeneCards: LBP
Пов'язані генетичні захворювання
періодонтит
Онтологія гена Молекулярна функція • lipoteichoic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding • signaling receptor binding • lipopolysaccharide binding • ліпопептидний зв'язок Клітинна компонента • мембрана • екзосома • extracellular region • cell surface • міжклітинний простір Біологічний процес • detection of molecule of bacterial origin • lipid transport • toll-like receptor 4 signaling pathway • процес імунної системи • leukocyte chemotaxis involved in inflammatory response • cellular defense response • cellular response to lipoteichoic acid • defense response to bacterium • GO:0015921 lipopolysaccharide transport • positive regulation of interleukin-8 production • positive regulation of interleukin-6 production • positive regulation of neutrophil chemotaxis • positive regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway • positive regulation of chemokine production • negative regulation of tumor necrosis factor production • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • Опсонізація • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • positive regulation of tumor necrosis factor production • response to lipopolysaccharide • macrophage activation involved in immune response • positive regulation of respiratory burst involved in inflammatory response • acute-phase response • вроджений імунітет • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • cellular response to lipopolysaccharide • positive regulation of macrophage activation • toll-like receptor signaling pathway • macromolecule localization • positive regulation of cytolysis • GO:0015915 транспорт • cytokine-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3929	16803
Ensembl	ENSG00000129988	ENSMUSG00000016024
UniProt	P18428	Q61805
RefSeq (мРНК)	NM_004139	NM_008489
RefSeq (білок)	NP_004130	NP_032515
Локус (UCSC)	Хр. 20: 38.35 – 38.38 Mb	Хр. 2: 158.15 – 158.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LBP (англ. Lipopolysaccharide binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 481 амінокислот, а молекулярна маса — 53 384.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGALARALPS		ILLALLLTST		PEALGANPGL		VARITDKGLQ		YAAQEGLLAL
QSELLRITLP		DFTGDLRIPH		VGRGRYEFHS		LNIHSCELLH		SALRPVPGQG
LSLSISDSSI		RVQGRWKVRK		SFFKLQGSFD		VSVKGISISV		NLLLGSESSG
RPTVTASSCS		SDIADVEVDM		SGDLGWLLNL		FHNQIESKFQ		KVLESRICEM
IQKSVSSDLQ		PYLQTLPVTT		EIDSFADIDY		SLVEAPRATA		QMLEVMFKGE
IFHRNHRSPV		TLLAAVMSLP		EEHNKMVYFA		ISDYVFNTAS		LVYHEEGYLN
FSITDDMIPP		DSNIRLTTKS		FRPFVPRLAR		LYPNMNLELQ		GSVPSAPLLN
FSPGNLSVDP		YMEIDAFVLL		PSSSKEPVFR		LSVATNVSAT		LTFNTSKITG
FLKPGKVKVE		LKESKVGLFN		AELLEALLNY		YILNTFYPKF		NDKLAEGFPL
PLLKRVQLYD		LGLQIHKDFL		FLGANVQYMR		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транспорт, транспорт ліпідів. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Hubacek J.A., Buchler C., Aslanidis C., Schmitz G. (1997). The genomic organization of the genes for human lipopolysaccharide binding protein (LBP) and bactericidal permeability increasing protein (BPI) is highly conserved. Biochem. Biophys. Res. Commun. 236: 427—430. PMID 9240454 DOI:10.1006/bbrc.1997.6970
• Wright S.D., Ramos R.A., Tobias P.S., Ulevitch R.J., Mathison J.C. (1990). CD14, a receptor for complexes of lipopolysaccharide (LPS) and LPS binding protein. Science. 249: 1431—1433. PMID 1698311 DOI:10.1126/science.1698311
• Jerala R. (2007). Structural biology of the LPS recognition. Int. J. Med. Microbiol. 297: 353—363. PMID 17481951 DOI:10.1016/j.ijmm.2007.04.001
• Tsukamoto H., Fukudome K., Takao S., Tsuneyoshi N., Kimoto M. (2010). Lipopolysaccharide-binding protein-mediated Toll-like receptor 4 dimerization enables rapid signal transduction against lipopolysaccharide stimulation on membrane-associated CD14-expressing cells. Int. Immunol. 22: 271—280. PMID 20133493 DOI:10.1093/intimm/dxq005
• Long J.Y., Liu J.Q., Xue Y.N., Wang H.X. (1998). Cloning and sequencing of human lipopolysaccharide-binding protein gene. Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Jin Zhan. 25: 469—471.

Див. також

• Хромосома 20