NXT1

NXT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1JKG, 1JN5, 4WYK
Ідентифікатори
Символи	NXT1, MTR2, P15, nuclear transport factor 2 like export factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605811 MGI: 1929619 HomoloGene: 8301 GeneCards: NXT1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • nuclear speck • ядерна пора • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear pore central transport channel Біологічний процес • protein export from nucleus • protein transport • RNA export from nucleus • mRNA export from nucleus • protein import into nucleus • nucleocytoplasmic transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29107	56488
Ensembl	ENSG00000132661	ENSMUSG00000036992
UniProt	Q9UKK6	Q9QZV9
RefSeq (мРНК)	NM_013248	NM_001110159 NM_019761
RefSeq (білок)	NP_037380	NP_001103629 NP_062735
Локус (UCSC)	Хр. 20: 23.35 – 23.35 Mb	Хр. 2: 148.51 – 148.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NXT1 (англ. Nuclear transport factor 2 like export factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 140 амінокислот, а молекулярна маса — 15 847.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASVDFKTYV		DQACRAAEEF		VNVYYTTMDK		RRRLLSRLYM		GTATLVWNGN
AVSGQESLSE		FFEMLPSSEF		QISVVDCQPV		HDEATPSQTT		VLVVICGSVK
FEGNKQRDFN		QNFILTAQAS		PSNTVWKIAS		DCFRFQDWAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Black B.E., Levesque L., Holaska J.M., Wood T.C., Paschal B.M. (1999). Identification of an NTF2-related factor that binds Ran-GTP and regulates nuclear protein export. Mol. Cell. Biol. 19: 8616—8624. PMID 10567585 DOI:10.1128/MCB.19.12.8616
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Katahira J., Inoue H., Hurt E., Yoneda Y. (2009). Adaptor Aly and co-adaptor Thoc5 function in the Tap-p15-mediated nuclear export of HSP70 mRNA. EMBO J. 28: 556—567. PMID 19165146 DOI:10.1038/emboj.2009.5
• Fribourg S., Braun I.C., Izaurralde E., Conti E. (2001). Structural basis for the recognition of a nucleoporin FG repeat by the NTF2-like domain of the TAP/p15 mRNA nuclear export factor. Mol. Cell. 8: 645—656. PMID 11583626 DOI:10.1016/S1097-2765(01)00348-3

Див. також

• Хромосома 20