PTPRM

PTPRM
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1RPM, 2C9A, 2V5Y
Ідентифікатори
Символи	PTPRM, PTPRL1, R-PTP-MU, RPTPM, RPTPU, hR-PTPu, protein tyrosine phosphatase, receptor type M, protein tyrosine phosphatase receptor type M
Зовнішні ІД	OMIM: 176888 MGI: 102694 HomoloGene: 37694 GeneCards: PTPRM
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphoprotein phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • cadherin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • protein tyrosine phosphatase activity • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • cell-cell junction • integral component of plasma membrane • perinuclear region of cytoplasm • lamellipodium • клітинна мембрана Біологічний процес • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • retina layer formation • GO:0016576 protein dephosphorylation • negative regulation of endothelial cell migration • negative regulation of endothelial cell proliferation • адгезія клітин • negative regulation of angiogenesis • neuron projection development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • retinal ganglion cell axon guidance • peptidyl-tyrosine dephosphorylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5797	19274
Ensembl	ENSG00000173482	ENSMUSG00000033278
UniProt	P28827	P28828
RefSeq (мРНК)	NM_001105244 NM_002845 NM_001378142 NM_001378143 NM_001378144 NM_001378145 NM_001378146 NM_001378147	NM_008984 NM_001357625
RefSeq (білок)	NP_001098714 NP_002836 NP_001365071 NP_001365072 NP_001365073 NP_001365074 NP_001365075 NP_001365076	NP_033010 NP_001344554
Локус (UCSC)	Хр. 18: 7.57 – 8.41 Mb	Хр. 17: 66.97 – 67.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPRM (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 452 амінокислот, а молекулярна маса — 163 682.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRGLGTCLAT		LAGLLLTAAG		ETFSGGCLFD		EPYSTCGYSQ		SEGDDFNWEQ
VNTLTKPTSD		PWMPSGSFML		VNASGRPEGQ		RAHLLLPQLK		ENDTHCIDFH
YFVSSKSNSP		PGLLNVYVKV		NNGPLGNPIW		NISGDPTRTW		NRAELAISTF
WPNFYQVIFE		VITSGHQGYL		AIDEVKVLGH		PCTRTPHFLR		IQNVEVNAGQ
FATFQCSAIG		RTVAGDRLWL		QGIDVRDAPL		KEIKVTSSRR		FIASFNVVNT
TKRDAGKYRC		MIRTEGGVGI		SNYAELVVKE		PPVPIAPPQL		ASVGATYLWI
QLNANSINGD		GPIVAREVEY		CTASGSWNDR		QPVDSTSYKI		GHLDPDTEYE
ISVLLTRPGE		GGTGSPGPAL		RTRTKCADPM		RGPRKLEVVE		VKSRQITIRW
EPFGYNVTRC		HSYNLTVHYC		YQVGGQEQVR		EEVSWDTENS		HPQHTITNLS
PYTNVSVKLI		LMNPEGRKES		QELIVQTDED		LPGAVPTESI		QGSTFEEKIF
LQWREPTQTY		GVITLYEITY		KAVSSFDPEI		DLSNQSGRVS		KLGNETHFLF
FGLYPGTTYS		FTIRASTAKG		FGPPATNQFT		TKISAPSMPA		YELETPLNQT
DNTVTVMLKP		AHSRGAPVSV		YQIVVEEERP		RRTKKTTEIL		KCYPVPIHFQ
NASLLNSQYY		FAAEFPADSL		QAAQPFTIGD		NKTYNGYWNT		PLLPYKSYRI
YFQAASRANG		ETKIDCVQVA		TKGAATPKPV		PEPEKQTDHT		VKIAGVIAGI
LLFVIIFLGV		VLVMKKRKLA		KKRKETMSST		RQEMTVMVNS		MDKSYAEQGT
NCDEAFSFMD		THNLNGRSVS		SPSSFTMKTN		TLSTSVPNSY		YPDETHTMAS
DTSSLVQSHT		YKKREPADVP		YQTGQLHPAI		RVADLLQHIT		QMKCAEGYGF
KEEYESFFEG		QSAPWDSAKK		DENRMKNRYG		NIIAYDHSRV		RLQTIEGDTN
SDYINGNYID		GYHRPNHYIA		TQGPMQETIY		DFWRMVWHEN		TASIIMVTNL
VEVGRVKCCK		YWPDDTEIYK		DIKVTLIETE		LLAEYVIRTF		AVEKRGVHEI
REIRQFHFTG		WPDHGVPYHA		TGLLGFVRQV		KSKSPPSAGP		LVVHCSAGAG
RTGCFIVIDI		MLDMAEREGV		VDIYNCVREL		RSRRVNMVQT		EEQYVFIHDA
ILEACLCGDT		SVPASQVRSL		YYDMNKLDPQ		TNSSQIKEEF		RTLNMVTPTL
RVEDCSIALL		PRNHEKNRCM		DILPPDRCLP		FLITIDGESS		NYINAALMDS
YKQPSAFIVT		QHPLPNTVKD		FWRLVLDYHC		TSVVMLNDVD		PAQLCPQYWP
ENGVHRHGPI		QVEFVSADLE		EDIISRIFRI		YNAARPQDGY		RMVQQFQFLG
WPMYRDTPVS		KRSFLKLIRQ		VDKWQEEYNG		GEGRTVVHCL		NGGGRSGTFC
AISIVCEMLR		HQRTVDVFHA		VKTLRNNKPN		MVDLLDQYKF		CYEVALEYLN
SG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hoffmann K.M., Tonks N.K., Barford D. (1997). The crystal structure of domain 1 of receptor protein-tyrosine phosphatase mu. J. Biol. Chem. 272: 27505—27508. PMID 9346878 DOI:10.1074/jbc.272.44.27505

Див. також

• Хромосома 18