SHROOM3
SHROOM3 (англ. Shroom family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 996 амінокислот, а молекулярна маса — 216 857[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MMRTTEDFHK | PSATLNSNTA | TKGRYIYLEA | FLEGGAPWGF | TLKGGLEHGE | ||||
PLIISKVEEG | GKADTLSSKL | QAGDEVVHIN | EVTLSSSRKE | AVSLVKGSYK | ||||
TLRLVVRRDV | CTDPGHADTG | ASNFVSPEHL | TSGPQHRKAA | WSGGVKLRLK | ||||
HRRSEPAGRP | HSWHTTKSGE | KQPDASMMQI | SQGMIGPPWH | QSYHSSSSTS | ||||
DLSNYDHAYL | RRSPDQCSSQ | GSMESLEPSG | AYPPCHLSPA | KSTGSIDQLS | ||||
HFHNKRDSAY | SSFSTSSSIL | EYPHPGISGR | ERSGSMDNTS | ARGGLLEGMR | ||||
QADIRYVKTV | YDTRRGVSAE | YEVNSSALLL | QGREARASAN | GQGYDKWSNI | ||||
PRGKGVPPPS | WSQQCPSSLE | TATDNLPPKV | GAPLPPARSD | SYAAFRHRER | ||||
PSSWSSLDQK | RLCRPQANSL | GSLKSPFIEE | QLHTVLEKSP | ENSPPVKPKH | ||||
NYTQKAQPGQ | PLLPTSIYPV | PSLEPHFAQV | PQPSVSSNGM | LYPALAKESG | ||||
YIAPQGACNK | MATIDENGNQ | NGSGRPGFAF | CQPLEHDLLS | PVEKKPEATA | ||||
KYVPSKVHFC | SVPENEEDAS | LKRHLTPPQG | NSPHSNERKS | THSNKPSSHP | ||||
HSLKCPQAQA | WQAGEDKRSS | RLSEPWEGDF | QEDHNANLWR | RLEREGLGQS | ||||
LSGNFGKTKS | AFSSLQNIPE | SLRRHSSLEL | GRGTQEGYPG | GRPTCAVNTK | ||||
AEDPGRKAAP | DLGSHLDRQV | SYPRPEGRTG | ASASFNSTDP | SPEEPPAPSH | ||||
PHTSSLGRRG | PGPGSASALQ | GFQYGKPHCS | VLEKVSKFEQ | REQGSQRPSV | ||||
GGSGFGHNYR | PHRTVSTSST | SGNDFEETKA | HIRFSESAEP | LGNGEQHFKN | ||||
GELKLEEASR | QPCGQQLSGG | ASDSGRGPQR | PDARLLRSQS | TFQLSSEPER | ||||
EPEWRDRPGS | PESPLLDAPF | SRAYRNSIKD | AQSRVLGATS | FRRRDLELGA | ||||
PVASRSWRPR | PSSAHVGLRS | PEASASASPH | TPRERHSVTP | AEGDLARPVP | ||||
PAARRGARRR | LTPEQKKRSY | SEPEKMNEVG | IVEEAEPAPL | GPQRNGMRFP | ||||
ESSVADRRRL | FERDGKACST | LSLSGPELKQ | FQQSALADYI | QRKTGKRPTS | ||||
AAGCSLQEPG | PLRERAQSAY | LQPGPAALEG | SGLASASSLS | SLREPSLQPR | ||||
REATLLPATV | AETQQAPRDR | SSSFAGGRRL | GERRRGDLLS | GANGGTRGTQ | ||||
RGDETPREPS | SWGARAGKSM | SAEDLLERSD | VLAGPVHVRS | RSSPATADKR | ||||
QDVLLGQDSG | FGLVKDPCYL | AGPGSRSLSC | SERGQEEMLP | LFHHLTPRWG | ||||
GSGCKAIGDS | SVPSECPGTL | DHQRQASRTP | CPRPPLAGTQ | GLVTDTRAAP | ||||
LTPIGTPLPS | AIPSGYCSQD | GQTGRQPLPP | YTPAMMHRSN | GHTLTQPPGP | ||||
RGCEGDGPEH | GVEEGTRKRV | SLPQWPPPSR | AKWAHAARED | SLPEESSAPD | ||||
FANLKHYQKQ | QSLPSLCSTS | DPDTPLGAPS | TPGRISLRIS | ESVLRDSPPP | ||||
HEDYEDEVFV | RDPHPKATSS | PTFEPLPPPP | PPPPSQETPV | YSMDDFPPPP | ||||
PHTVCEAQLD | SEDPEGPRPS | FNKLSKVTIA | RERHMPGAAH | VVGSQTLASR | ||||
LQTSIKGSEA | ESTPPSFMSV | HAQLAGSLGG | QPAPIQTQSL | SHDPVSGTQG | ||||
LEKKVSPDPQ | KSSEDIRTEA | LAKEIVHQDK | SLADILDPDS | RLKTTMDLME | ||||
GLFPRDVNLL | KENSVKRKAI | QRTVSSSGCE | GKRNEDKEAV | SMLVNCPAYY | ||||
SVSAPKAELL | NKIKEMPAEV | NEEEEQADVN | EKKAELIGSL | THKLETLQEA | ||||
KGSLLTDIKL | NNALGEEVEA | LISELCKPNE | FDKYRMFIGD | LDKVVNLLLS | ||||
LSGRLARVEN | VLSGLGEDAS | NEERSSLYEK | RKILAGQHED | ARELKENLDR | ||||
RERVVLGILA | NYLSEEQLQD | YQHFVKMKST | LLIEQRKLDD | KIKLGQEQVK | ||||
CLLESLPSDF | IPKAGALALP | PNLTSEPIPA | GGCTFSGIFP | TLTSPL |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пдтримання форми клітини, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SHROOM3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30422 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q8TF72 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |