SHROOM3

SHROOM3
Ідентифікатори
Символи	SHROOM3, APXL3, SHRM, ShrmL, MSTP013, shroom family member 3
Зовнішні ІД	OMIM: 604570 MGI: 1351655 HomoloGene: 9263 GeneCards: SHROOM3
Пов'язані генетичні захворювання
захворювання нирок
Онтологія гена Молекулярна функція • actin filament binding • actin binding Клітинна компонента • apical plasma membrane • Міжклітинні контакти • Адгезивні контакти • цитоплазма • apical junction complex • мікротрубочка • Цитоскелет • cortical actin cytoskeleton Біологічний процес • cellular pigment accumulation • multicellular organism development • apical protein localization • regulation of cell shape • neural tube closure • epithelial cell development • pattern specification process • GO:0000767 cell morphogenesis • actin filament organization • actin cytoskeleton organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57619	27428
Ensembl	ENSG00000138771	ENSMUSG00000029381
UniProt	Q8TF72	Q9QXN0
RefSeq (мРНК)	NM_020859	NM_001077595 NM_001077596 NM_015756
RefSeq (білок)	NP_065910	NP_001071063 NP_001071064 NP_056571
Локус (UCSC)	Хр. 4: 76.44 – 76.78 Mb	Хр. 5: 92.83 – 93.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SHROOM3 (англ. Shroom family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 996 амінокислот, а молекулярна маса — 216 857.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMRTTEDFHK		PSATLNSNTA		TKGRYIYLEA		FLEGGAPWGF		TLKGGLEHGE
PLIISKVEEG		GKADTLSSKL		QAGDEVVHIN		EVTLSSSRKE		AVSLVKGSYK
TLRLVVRRDV		CTDPGHADTG		ASNFVSPEHL		TSGPQHRKAA		WSGGVKLRLK
HRRSEPAGRP		HSWHTTKSGE		KQPDASMMQI		SQGMIGPPWH		QSYHSSSSTS
DLSNYDHAYL		RRSPDQCSSQ		GSMESLEPSG		AYPPCHLSPA		KSTGSIDQLS
HFHNKRDSAY		SSFSTSSSIL		EYPHPGISGR		ERSGSMDNTS		ARGGLLEGMR
QADIRYVKTV		YDTRRGVSAE		YEVNSSALLL		QGREARASAN		GQGYDKWSNI
PRGKGVPPPS		WSQQCPSSLE		TATDNLPPKV		GAPLPPARSD		SYAAFRHRER
PSSWSSLDQK		RLCRPQANSL		GSLKSPFIEE		QLHTVLEKSP		ENSPPVKPKH
NYTQKAQPGQ		PLLPTSIYPV		PSLEPHFAQV		PQPSVSSNGM		LYPALAKESG
YIAPQGACNK		MATIDENGNQ		NGSGRPGFAF		CQPLEHDLLS		PVEKKPEATA
KYVPSKVHFC		SVPENEEDAS		LKRHLTPPQG		NSPHSNERKS		THSNKPSSHP
HSLKCPQAQA		WQAGEDKRSS		RLSEPWEGDF		QEDHNANLWR		RLEREGLGQS
LSGNFGKTKS		AFSSLQNIPE		SLRRHSSLEL		GRGTQEGYPG		GRPTCAVNTK
AEDPGRKAAP		DLGSHLDRQV		SYPRPEGRTG		ASASFNSTDP		SPEEPPAPSH
PHTSSLGRRG		PGPGSASALQ		GFQYGKPHCS		VLEKVSKFEQ		REQGSQRPSV
GGSGFGHNYR		PHRTVSTSST		SGNDFEETKA		HIRFSESAEP		LGNGEQHFKN
GELKLEEASR		QPCGQQLSGG		ASDSGRGPQR		PDARLLRSQS		TFQLSSEPER
EPEWRDRPGS		PESPLLDAPF		SRAYRNSIKD		AQSRVLGATS		FRRRDLELGA
PVASRSWRPR		PSSAHVGLRS		PEASASASPH		TPRERHSVTP		AEGDLARPVP
PAARRGARRR		LTPEQKKRSY		SEPEKMNEVG		IVEEAEPAPL		GPQRNGMRFP
ESSVADRRRL		FERDGKACST		LSLSGPELKQ		FQQSALADYI		QRKTGKRPTS
AAGCSLQEPG		PLRERAQSAY		LQPGPAALEG		SGLASASSLS		SLREPSLQPR
REATLLPATV		AETQQAPRDR		SSSFAGGRRL		GERRRGDLLS		GANGGTRGTQ
RGDETPREPS		SWGARAGKSM		SAEDLLERSD		VLAGPVHVRS		RSSPATADKR
QDVLLGQDSG		FGLVKDPCYL		AGPGSRSLSC		SERGQEEMLP		LFHHLTPRWG
GSGCKAIGDS		SVPSECPGTL		DHQRQASRTP		CPRPPLAGTQ		GLVTDTRAAP
LTPIGTPLPS		AIPSGYCSQD		GQTGRQPLPP		YTPAMMHRSN		GHTLTQPPGP
RGCEGDGPEH		GVEEGTRKRV		SLPQWPPPSR		AKWAHAARED		SLPEESSAPD
FANLKHYQKQ		QSLPSLCSTS		DPDTPLGAPS		TPGRISLRIS		ESVLRDSPPP
HEDYEDEVFV		RDPHPKATSS		PTFEPLPPPP		PPPPSQETPV		YSMDDFPPPP
PHTVCEAQLD		SEDPEGPRPS		FNKLSKVTIA		RERHMPGAAH		VVGSQTLASR
LQTSIKGSEA		ESTPPSFMSV		HAQLAGSLGG		QPAPIQTQSL		SHDPVSGTQG
LEKKVSPDPQ		KSSEDIRTEA		LAKEIVHQDK		SLADILDPDS		RLKTTMDLME
GLFPRDVNLL		KENSVKRKAI		QRTVSSSGCE		GKRNEDKEAV		SMLVNCPAYY
SVSAPKAELL		NKIKEMPAEV		NEEEEQADVN		EKKAELIGSL		THKLETLQEA
KGSLLTDIKL		NNALGEEVEA		LISELCKPNE		FDKYRMFIGD		LDKVVNLLLS
LSGRLARVEN		VLSGLGEDAS		NEERSSLYEK		RKILAGQHED		ARELKENLDR
RERVVLGILA		NYLSEEQLQD		YQHFVKMKST		LLIEQRKLDD		KIKLGQEQVK
CLLESLPSDF		IPKAGALALP		PNLTSEPIPA		GGCTFSGIFP		TLTSPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пдтримання форми клітини, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4