TOPORS

TOPORS
Ідентифікатори
Символи	TOPORS, LUN, P53BP3, RP31, TP53BPL, TOP1 binding arginine/serine rich protein, TOP1 binding arginine/serine rich protein, E3 ubiquitin ligase
Зовнішні ІД	OMIM: 609507 MGI: 2146189 HomoloGene: 4237 GeneCards: TOPORS
Пов'язані генетичні захворювання
retinitis pigmentosa 31
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0003823, GO:0051635 antigen binding • DNA binding • SUMO transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • DNA topoisomerase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity Клітинна компонента • ciliary basal body • PML body • nuclear speck • spindle pole • ubiquitin ligase complex • gamma-tubulin complex • photoreceptor connecting cilium • midbody • cytoplasmic dynein complex • Центріоль • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator • retina layer formation • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein polyubiquitination • negative regulation of apoptotic process • retinal cone cell development • protein monoubiquitination • photoreceptor cell outer segment organization • protein sumoylation • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • protein K48-linked ubiquitination • regulation of cell population proliferation • positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity • retinal rod cell development • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • protein localization to nucleus • maintenance of protein location in nucleus • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10210	106021
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000036822
UniProt	Q9NS56	Q80Z37
RefSeq (мРНК)	NM_005802 NM_001195622	NM_134097
RefSeq (білок)	NP_001182551 NP_005793	NP_598858
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 4: 40.26 – 40.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TOPORS (англ. TOP1 binding arginine/serine rich protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 045 амінокислот, а молекулярна маса — 119 198.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSQPPLGSP		LSREEGEAPP		PAPASEGRRR		SRRVRLRGSC		RHRPSFLGCR
ELAASAPARP		APASSEIMAS		AAKEFKMDNF		SPKAGTSKLQ		QTVPADASPD
SKCPICLDRF		DNVSYLDRCL		HKFCFRCVQE		WSKNKAECPL		CKQPFDSIFH
SVRAEDDFKE		YVLRPSYNGS		FVTPDRRFRY		RTTLTRERNA		SVYSPSGPVN
RRTTTPPDSG		VLFEGLGIST		RPRDVEIPQF		MRQIAVRRPT		TADERSLRKI
QEQDIINFRR		TLYRAGARVR		NIEDGGRYRD		ISAEFFRRNP		ACLHRLVPWL
KRELTVLFGA		HGSLVNIVQH		IIMSNVTRYD		LESQAFVSDL		RPFLLNRTEH
FIHEFISFAR		SPFNMAAFDQ		HANYDCPAPS		YEEGSHSDSS		VITISPDEAE
TQELDINVAT		VSQAPWDDET		PGPSYSSSEQ		VHVTMSSLLN		TSDSSDEELV
TGGATSQIQG		VQTNDDLNND		SDDSSDNCVI		VGFVKPLAER		TPELVELSSD
SEDLGSYEKM		ETVKTQEQEQ		SYSSGDSDVS		RCSSPHSVLG		KDEQINKGHC
DSSTRIKSKK		EEKRSTSLSS		PRNLNSSVRG		DRVYSPYNHR		HRKRGRSRSS
DSRSQSRSGH		DQKNHRKHHG		KKRMKSKRSR		SRESSRPRGR		RDKKRSRTRD
SSWSRRSQTL		SLSSESTSRS		RSRSSDHGKR		RSRSRNRDRY		YLRNNYGSRY
KWEYTYYSRN		KDRDGYESSY		RRRTLSRAHY		SRQSSSPEFR		VQSFSERTNA
RKKNNHSERK		YYYYERHRSR		SLSSNRSRTA		STGTDRVRNE		KPGGKRKYKT
RHLEGTNEVA		QPSREFASKA		KDSHYQKSSS		KLDGNYKNES		DTFSDSRSSD
RETKHKRRKR		KTRSLSVEIV		YEGKATDTTK		HHKKKKKKHK		KKHKKHHGDN
ASRSPVVITI		DSDSDKDSEV		KEDTECDNSG		PQDPLQNEFL		APSLEPFETK
DVVTIEAEFG		VLDKECDIAT		LSNNLNNANK		TVDNIPPLAA		SVEQTLDVRE
ESTFVSDLEN		QPSNIVSLQT		EPSRQLPSPR		TSLMSVCLGR		DCDMS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhou R., Wen H., Ao S.-Z. (1999). Identification of a novel gene encoding a p53-associated protein. Gene. 235: 93—101. PMID 10415337 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00203-6
• Rasheed Z.A., Saleem A., Ravee Y., Pandolfi P.P., Rubin E.H. (2002). The topoisomerase I-binding RING protein, topors, is associated with promyelocytic leukemia nuclear bodies. Exp. Cell Res. 277: 152—160. PMID 12083797 DOI:10.1006/excr.2002.5550
• Weger S., Hammer E., Engstler M. (2003). The DNA topoisomerase I binding protein topors as a novel cellular target for SUMO-1 modification: characterization of domains necessary for subcellular localization and sumolation. Exp. Cell Res. 290: 13—27. PMID 14516784 DOI:10.1016/S0014-4827(03)00292-1
• Weger S., Hammer E., Heilbronn R. (2005). Topors acts as a SUMO-1 E3 ligase for p53 in vitro and in vivo. FEBS Lett. 579: 5007—5012. PMID 16122737 DOI:10.1016/j.febslet.2005.07.088
• Renner F., Moreno R., Schmitz M.L. (2010). SUMOylation-dependent localization of IKKepsilon in PML nuclear bodies is essential for protection against DNA-damage-triggered cell death. Mol. Cell. 37: 503—515. PMID 20188669 DOI:10.1016/j.molcel.2010.01.018

Див. також

• Хромосома 9