TUBB3

TUBB3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5IJ0, 5JCO, 5IJ9
Ідентифікатори
Символи	TUBB3, CDCBM, CDCBM1, CFEOM3, CFEOM3A, FEOM3, TUBB4, beta-4, tubulin beta 3 class III
Зовнішні ІД	OMIM: 602661 MGI: 107813 HomoloGene: 68503 GeneCards: TUBB3
Пов'язані генетичні захворювання
congenital fibrosis of the extraocular muscles, complex cortical dysplasia with other brain malformations 1
Реагує на сполуку
combrestatin A-4
velban
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity • netrin receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • мікротрубочка • екзосома • цитоскелет • клітинне ядро • microtubule cytoskeleton • дендрит (нейробіологія) • аксон • lamellipodium • Філоподія • growth cone • cell projection Біологічний процес • microtubule-based process • cytoskeleton organization • axon guidance • microtubule cytoskeleton organization • GO:0007067 мітоз • neuron differentiation • netrin-activated signaling pathway • dorsal root ganglion development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10381	22152
Ensembl	ENSG00000258947	ENSMUSG00000062380
UniProt	Q13509	Q9ERD7
RefSeq (мРНК)	NM_006086 NM_001197181	NM_023279
RefSeq (білок)	NP_001184110 NP_006077	NP_075768
Локус (UCSC)	Хр. 16: 89.92 – 89.94 Mb	Хр. 8: 124.14 – 124.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TUBB3 (англ. Tubulin beta 3 class III) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 450 амінокислот, а молекулярна маса — 50 433.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MREIVHIQAG		QCGNQIGAKF		WEVISDEHGI		DPSGNYVGDS		DLQLERISVY
YNEASSHKYV		PRAILVDLEP		GTMDSVRSGA		FGHLFRPDNF		IFGQSGAGNN
WAKGHYTEGA		ELVDSVLDVV		RKECENCDCL		QGFQLTHSLG		GGTGSGMGTL
LISKVREEYP		DRIMNTFSVV		PSPKVSDTVV		EPYNATLSIH		QLVENTDETY
CIDNEALYDI		CFRTLKLATP		TYGDLNHLVS		ATMSGVTTSL		RFPGQLNADL
RKLAVNMVPF		PRLHFFMPGF		APLTARGSQQ		YRALTVPELT		QQMFDAKNMM
AACDPRHGRY		LTVATVFRGR		MSMKEVDEQM		LAIQSKNSSY		FVEWIPNNVK
VAVCDIPPRG		LKMSSTFIGN		STAIQELFKR		ISEQFTAMFR		RKAFLHWYTG
EGMDEMEFTE		AESNMNDLVS		EYQQYQDATA		EEEGEMYEDD		EEESEAQGPK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Ranganathan S., Dexter D.W., Benetatos C.A., Hudes G.R. (1998). Cloning and sequencing of human betaIII-tubulin cDNA: induction of betaIII isotype in human prostate carcinoma cells by acute exposure to antimicrotubule agents. Biochim. Biophys. Acta. 1395: 237—245. PMID 9473684 DOI:10.1016/S0167-4781(97)00168-1
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Valenstein M.L., Roll-Mecak A. (2016). Graded control of microtubule severing by tubulin glutamylation. Cell. 164: 911—921. PMID 26875866 DOI:10.1016/j.cell.2016.01.019
• Katsetos C.D., Legido A., Perentes E., Mork S.J. (2003). Class III beta-tubulin isotype: a key cytoskeletal protein at the crossroads of developmental neurobiology and tumor neuropathology. J. Child Neurol. 18: 851—866. PMID 14736079
• Katsetos C.D., Legido A., Perentes E., Mork S.J. (2004). J. Child Neurol. 19: 531—531. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Див. також

• Хромосома 16