VPS33B

VPS33B
Ідентифікатори
Символи	VPS33B, late endosome and lysosome associated, VPS33B late endosome and lysosome associated
Зовнішні ІД	OMIM: 608552 MGI: 2446237 HomoloGene: 10261 GeneCards: VPS33B
Пов'язані генетичні захворювання
arthrogryposis–renal dysfunction–cholestasis syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • HOPS complex • platelet alpha granule • recycling endosome • AP-3 adaptor complex • ендосома • late endosome • early endosome membrane • мембрана • late endosome membrane • Клатрин • lysosomal membrane • early endosome • perinuclear region of cytoplasm • лізосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle Біологічний процес • megakaryocyte development • endosome to lysosome transport • platelet alpha granule organization • membrane fusion • melanosome localization • endosome organization • vesicle docking involved in exocytosis • GO:0000046 autophagosome maturation • lysosome localization • GO:0015915 транспорт • protein transport • vesicle-mediated transport • regulation of platelet aggregation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26276	233405
Ensembl	ENSG00000184056	ENSMUSG00000030534
UniProt	Q9H267	P59016
RefSeq (мРНК)	NM_001289148 NM_001289149 NM_018668	NM_178070
RefSeq (білок)	NP_001276077 NP_001276078 NP_061138	NP_835171
Локус (UCSC)	Хр. 15: 91 – 91.02 Mb	Хр. 7: 79.92 – 79.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VPS33B (англ. VPS33B, late endosome and lysosome associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 617 амінокислот, а молекулярна маса — 70 585.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAFPHRPDAP		ELPDFSMLKR		LARDQLIYLL		EQLPGKKDLF		IEADLMSPLD
RIANVSILKQ		HEVDKLYKVE		NKPALSSNEQ		LCFLVRPRIK		NMRYIASLVN
ADKLAGRTRK		YKVIFSPQKF		YACEMVLEEE		GIYGDVSCDE		WAFSLLPLDV
DLLSMELPEF		FRDYFLEGDQ		RWINTVAQAL		HLLSTLYGPF		PNCYGIGRCA
KMAYELWRNL		EEEEDGETKG		RRPEIGHIFL		LDRDVDFVTA		LCSQVVYEGL
VDDTFRIKCG		SVDFGPEVTS		SDKSLKVLLN		AEDKVFNEIR		NEHFSNVFGF
LSQKARNLQA		QYDRRRGMDI		KQMKNFVSQE		LKGLKQEHRL		LSLHIGACES
IMKKKTKQDF		QELIKTEHAL		LEGFNIREST		SYIEEHIDRQ		VSPIESLRLM
CLLSITENGL		IPKDYRSLKT		QYLQSYGPEH		LLTFSNLRRA		GLLTEQAPGD
TLTAVESKVS		KLVTDKAAGK		ITDAFSSLAK		RSNFRAISKK		LNLIPRVDGE
YDLKVPRDMA		YVFGGAYVPL		SCRIIEQVLE		RRSWQGLDEV		VRLLNCSDFA
FTDMTKEDKA		SSESLRLILV		VFLGGCTFSE		ISALRFLGRE		KGYRFIFLTT
AVTNSARLME		AMSEVKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bach H., Papavinasasundaram K.G., Wong D., Hmama Z., Av-Gay Y. (2008). Mycobacterium tuberculosis virulence is mediated by PtpA dephosphorylation of human vacuolar protein sorting 33B. Cell Host Microbe. 3: 316—322. PMID 18474358 DOI:10.1016/j.chom.2008.03.008
• Zlatic S.A., Tornieri K., L'Hernault S.W., Faundez V. (2011). Clathrin-dependent mechanisms modulate the subcellular distribution of class C Vps/HOPS tether subunits in polarized and nonpolarized cells. Mol. Biol. Cell. 22: 1699—1715. PMID 21411634 DOI:10.1091/mbc.E10-10-0799
• Carim-Todd L., Sumoy L., Andreu N., Estivill X., Escarceller M. (2000). Cloning, mapping and expression analysis of VPS33B, the human orthologue of rat Vps33b. Cytogenet. Cell Genet. 89: 92—95. PMID 10894945

Див. також

• Хромосома 15