NTRK1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
NTRK1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи NTRK1, MTC, TRK, TRK1, TRKA, Trk-A, p140-TrkA, neurotrophic receptor tyrosine kinase 1
Зовнішні ІД OMIM: 191315 MGI: 97383 HomoloGene: 1898 GeneCards: NTRK1
Реагує на сполуку
entrectinib, altiratinib, milciclib[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_002529
NM_001007792
NM_001012331
NM_001033124
RefSeq (білок)
NP_001007793
NP_001012331
NP_002520
NP_001028296
Локус (UCSC) Хр. 1: 156.82 – 156.88 Mb Хр. 3: 87.69 – 87.7 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NTRK1 (англ. Neurotrophic receptor tyrosine kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 796 амінокислот, а молекулярна маса — 87 497[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRC
TRDGALDSLHHLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVK
SGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPL
HCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQV
PNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLT
LANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQ
PTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSPVDT
NSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGI
NRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDA
CVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEAS
ESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF
LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRD
LATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESIL
YRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPR
ACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, білків розвитку, тирозинових протеїнкіназ. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

  • Martin-Zanca D., Oskam R., Mitra G., Copeland T.D., Barbacid M. (1989). Molecular and biochemical characterization of the human trk proto-oncogene. Mol. Cell. Biol. 9: 24—33. PMID 2927393 DOI:10.1128/MCB.9.1.24
  • Indo Y., Mardy S., Tsuruta M., Karim M.A., Matsuda I. (1997). Structure and organization of the human TRKA gene encoding a high affinity receptor for nerve growth factor. Jpn. J. Hum. Genet. 42: 343—351. PMID 9290260 DOI:10.1007/BF02766957
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Fujimoto M., Kitazawa R., Maeda S., Kitazawa S. (2005). Methylation adjacent to negatively regulating AP-1 site reactivates TrkA gene expression during cancer progression. Oncogene. 24: 5108—5118. PMID 15870692 DOI:10.1038/sj.onc.1208697
  • Martin-Zanca D., Hughes S.H., Barbacid M. (1986). A human oncogene formed by the fusion of truncated tropomyosin and protein tyrosine kinase sequences. Nature. 319: 743—748. PMID 2869410 DOI:10.1038/319743a0
  • Hempstead B.L., Martin-Zanca D., Kaplan D.R., Parada L.F., Chao M.V. (1991). High-affinity NGF binding requires coexpression of the trk proto-oncogene and the low-affinity NGF receptor. Nature. 350: 678—683. PMID 1850821 DOI:10.1038/350678a0

Примітки

Див. також