ABLIM1

ABLIM1
Ідентифікатори
Символи	ABLIM1, ABLIM, LIMAB1, LIMATIN, abLIM-1, actin binding LIM protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602330 MGI: 1194500 HomoloGene: 40994 GeneCards: ABLIM1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, рак простати
Онтологія гена Молекулярна функція • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • actin filament binding Клітинна компонента • цитоплазма • lamellipodium • цитоскелет • stress fiber • actin cytoskeleton Біологічний процес • animal organ morphogenesis • cytoskeleton organization • lamellipodium assembly • зір • cilium assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3983	226251
Ensembl	ENSG00000099204	ENSMUSG00000025085
UniProt	O14639	Q8K4G5
RefSeq (мРНК)	NM_001003407 NM_001003408 NM_002313 NM_006720 NM_001322882 NM_001322883 NM_001322884 NM_001322885 NM_001322886 NM_001322887 NM_001322888 NM_001322889 NM_001322890 NM_001322891 NM_001322892 NM_001322893 NM_001322894 NM_001322895 NM_001322896 NM_001322897 NM_001322898 NM_001322899 NM_001322900 NM_001352440 NM_001352441 NM_001352442 NM_001352443	NM_001103177 NM_001103178 NM_001290813 NM_001290815 NM_001290816 NM_178688 NM_001347459 NM_001362445 NM_001362446
RefSeq (білок)	NP_001003407 NP_001309811 NP_001309812 NP_001309813 NP_001309814 NP_001309815 NP_001309816 NP_001309817 NP_001309818 NP_001309819 NP_001309820 NP_001309821 NP_001309822 NP_001309823 NP_001309824 NP_001309825 NP_001309826 NP_001309827 NP_001309828 NP_001309829 NP_002304 NP_006711 NP_001339369 NP_001339370 NP_001339371 NP_001339372	NP_001096647 NP_001096648 NP_001277742 NP_001277744 NP_001277745 NP_001334388 NP_848803 NP_001349374 NP_001349375
Локус (UCSC)	Хр. 10: 114.43 – 114.77 Mb	Хр. 19: 57.02 – 57.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ABLIM1 (англ. Actin binding LIM protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 778 амінокислот, а молекулярна маса — 87 688.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPAFLGLKCL		GKLCSSEKSK		VTSSERTSAR		GSNRKRLIVE		DRRVSGTSFT
AHRRATITHL		LYLCPKDYCP		RGRVCNSVDP		FVAHPQDPHH		PSEKPVIHCH
KCGEPCKGEV		LRVQTKHFHI		KCFTCKVCGC		DLAQGGFFIK		NGEYLCTLDY
QRMYGTRCHG		CGEFVEGEVV		TALGKTYHPN		CFACTICKRP		FPPGDRVTFN
GRDCLCQLCA		QPMSSSPKET		TFSSNCAGCG		RDIKNGQALL		ALDKQWHLGC
FKCKSCGKVL		TGEYISKDGA		PYCEKDYQGL		FGVKCEACHQ		FITGKVLEAG
DKHYHPSCAR		CSRCNQMFTE		GEEMYLQGST		VWHPDCKQST		KTEEKLRPTR
TSSESIYSRP		GSSIPGSPGH		TIYAKVDNEI		LDYKDLAAIP		KVKAIYDIER
PDLITYEPFY		TSGYDDKQER		QSLGESPRTL		SPTPSAEGYQ		DVRDRMIHRS
TSQGSINSPV		YSRHSYTPTT		SRSPQHFHRP		GNEPSSGRNS		PLPYRPDSRP
LTPTYAQAPK		HFHVPDQGIN		IYRKPPIYKQ		HAALAAQSKS		SEDIIKFSKF
PAAQAPDPSE		TPKIETDHWP		GPPSFAVVGP		DMKRRSSGRE		EDDEELLRRR
QLQEEQLMKL		NSGLGQLILK		EEMEKESRER		SSLLASRYDS		PINSASHIPS
SKTASLPGYG		RNGLHRPVST		DFAQYNSYGD		VSGGVRDYQT		LPDGHMPAMR
MDRGVSMPNM		LEPKIFPYEM		LMVTNRGRNK		ILREVDRTRL		ERHLAPEVFR
EIFGMSIQEF		DRLPLWRRND		MKKKAKLF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Roof D.J., Hayes A., Adamian M., Chishti A.H., Li T. (1997). Molecular characterization of abLIM, a novel actin-binding and double zinc finger protein. J. Cell Biol. 138: 575—588. PMID 9245787 DOI:10.1083/jcb.138.3.575
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 10