ADAMTS20

ADAMTS20
Ідентифікатори
Символи	ADAMTS20, ADAM-TS20, ADAMTS-20, GON-1, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20
Зовнішні ІД	OMIM: 611681 MGI: 2660628 HomoloGene: 11808 GeneCards: ADAMTS20
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0070122 peptidase activity • metalloendopeptidase activity • endopeptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • regulation of developmental pigmentation • positive regulation of signal transduction • extracellular matrix organization • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of melanocyte differentiation • протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80070	223838
Ensembl	ENSG00000173157	ENSMUSG00000022449
UniProt	P59510	P59511
RefSeq (мРНК)	NM_025003 NM_175851	NM_001164785 NM_001164786 NM_177431
RefSeq (білок)	NP_079279	NP_001158257 NP_001158258 NP_803180
Локус (UCSC)	Хр. 12: 43.35 – 43.55 Mb	Хр. 15: 94.17 – 94.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ADAMTS20 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 910 амінокислот, а молекулярна маса — 214 721.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWVAKWLTGL		LYHLSLFITR		SWEVDFHPRQ		EALVRTLTSY		EVVIPERVNE
FGEVFPQSHH		FSRQKRSSEA		LEPMPFRTHY		RFTAYGQLFQ		LNLTADASFL
AAGYTEVHLG		TPERGAWESD		AGPSDLRHCF		YRGQVNSQED		YKAVVSLCGG
LTGTFKGQNG		EYFLEPIMKA		DGNEYEDGHN		KPHLIYRQDL		NNSFLQTLKY
CSVSESQIKE		TSLPFHTYSN		MNEDLNVMKE		RVLGHTSKNV		PLKDERRHSR
KKRLISYPRY		IEIMVTADAK		VVSAHGSNLQ		NYILTLMSIV		ATIYKDPSIG
NLIHIVVVKL		VMIHREEEGP		VINFDGATTL		KNFCSWQQTQ		NDLDDVHPSH
HDTAVLITRE		DICSSKEKCN		MLGLSYLGTI		CDPLQSCFIN		EEKGLISAFT
IAHELGHTLG		VQHDDNPRCK		EMKVTKYHVM		APALSFHMSP		WSWSNCSRKY
VTEFLDTGYG		ECLLDKPDEE		IYNLPSELPG		SRYDGNKQCE		LAFGPGSQMC
PHINICMHLW		CTSTEKLHKG		CFTQHVPPAD		GTDCGPGMHC		RHGLCVNKET
ETRPVNGEWG		PWEPYSSCSR		TCGGGIESAT		RRCNRPEPRN		GGNYCVGRRM
KFRSCNTDSC		PKGTQDFREK		QCSDFNGKHL		DISGIPSNVR		WLPRYSGIGT
KDRCKLYCQV		AGTNYFYLLK		DMVEDGTPCG		TETHDICVQG		QCMAAGCDHV
LNSSAKIDKC		GVCGGDNSSC		KTITGVFNSS		HYGYNVVVKI		PAGATNVDIR
QYSYSGQPDD		SYLALSDAEG		NFLFNGNFLL		STSKKEINVQ		GTRTVIEYSG
SNNAVERINS		TNRQEKEILI		EVLCVGNLYN		PDVHYSFNIP		LEERSDMFTW
DPYGPWEGCT		KMCQGLQRRN		ITCIHKSDHS		VVSDKECDHL		PLPSFVTQSC
NTDCELRWHV		IGKSECSSQC		GQGYRTLDIH		CMKYSIHEGQ		TVQVDDHYCG
DQLKPPTQEL		CHGNCVFTRW		HYSEWSQCSR		SCGGGERSRE		SYCMNNFGHR
LADNECQELS		RVTRENCNEF		SCPSWAASEW		SECLVTCGKG		TKQRQVWCQL
NVDHLSDGFC		NSSTKPESLS		PCELHTCASW		QVGPWGPCTT		TCGHGYQMRD
VKCVNELASA		VLEDTECHEA		SRPSDRQSCV		LTPCSFISKL		ETALLPTVLI
KKMAQWRHGS		WTPCSVSCGR		GTQARYVSCR		DALDRIADES		YCAHLPRPAE
IWDCFTPCGE		WQAGDWSPCS		ASCGHGKTTR		QVLCMNYHQP		IDENYCDPEV
RPLMEQECSL		AACPPAHSHF		PSSPVQPSYY		LSTNLPLTQK		LEDNENQVVH
PSVRGNQWRT		GPWGSCSSSC		SGGLQHRAVV		CQDENGQSAS		YCDAASKPPE
LQQCGPGPCP		QWNYGNWGEC		SQTCGGGIKS		RLVICQFPNG		QILEDHNCEI
VNKPPSVIQC		HMHACPADVS		WHQEPWTSCS		ASCGKGRKYR		EVFCIDQFQR
KLEDTNCSQV		QKPPTHKACR		SVRCPSWKAN		SWNECSVTCG		SGVQQRDVYC
RLKGVGQVVE		EMCDQSTRPC		SQRRCWSQDC		VQHKGMERGR		LNCSTSCERK
DSHQRMECTD		NQIRQVNEIV		YNSSTISLTS		KNCRNPPCNY		IVVTADSSQC
ANNCGFSYRQ		RITYCTEIPS		TKKHKLHRLR		PIVYQECPVV		PSSQVYQCIN
SCLHLATWKV		GKWSKCSVTC		GIGIMKRQVK		CITKHGLSSD		LCLNHLKPGA
QKKCYANDCK		SFTTCKEIQV		KNHIRKDGDY		YLNIKGRIIK		IYCADMYLEN
PKEYLTLVQG		EENFSEVYGF		RLKNPYQCPF		NGSRREDCEC		DNGHLAAGYT
VFSKIRIDLT		SMQIKTTDLL		FSKTIFGNAV		PFATAGDCYS		AFRCPQGQFS
INLSGTGMKI		SSTAKWLTQG		SYTSVSIRRS		EDGTRFFGKC		GGYCGKCLPH
MTTGLPIQVI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Llamazares M., Cal S., Quesada V., Lopez-Otin C. (2003). Identification and characterization of ADAMTS-20 defines a novel subfamily of metalloproteinases-disintegrins with multiple thrombospondin-1 repeats and a unique GON domain. J. Biol. Chem. 278: 13382—13389. PMID 12562771 DOI:10.1074/jbc.M211900200

Див. також

• Хромосома 12