AFDN

AFDN
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1T2M, 1XZ9, 2AIN, 2EXG, 5A6C
Ідентифікатори
Символи	AFDN, AF6, MLL-AF6, MLLT4, myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia; translocated to, 4, afadin, adherens junction formation factor, l-afadin
Зовнішні ІД	OMIM: 159559 MGI: 1314653 HomoloGene: 21202 GeneCards: AFDN
Онтологія гена Молекулярна функція • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding • cell adhesion molecule binding • actin filament binding Клітинна компонента • Адгезивні контакти • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • нуклеоплазма • гіалоплазма • cell-cell junction • nuclear speck • cell-cell contact zone • Щільні контакти Біологічний процес • cell-cell signaling • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • адгезія клітин • establishment of endothelial intestinal barrier • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of protein localization • adherens junction organization • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of cell-cell adhesion • negative regulation of cell migration • cell-cell adhesion mediated by cadherin • establishment of protein localization to plasma membrane • bicellular tight junction assembly • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by cadherin Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4301	17356
Ensembl	ENSG00000130396	ENSMUSG00000068036
UniProt	P55196	Q9QZQ1
RefSeq (мРНК)	NM_001040000 NM_001040001 NM_001207008 NM_001291964 NM_005936 NM_001366319 NM_001366320 NM_001366321 NM_001386888	NM_010806
RefSeq (білок)	NP_001035089 NP_001193937 NP_001278893 NP_001353248 NP_001353249 NP_001353250	NP_034936
Локус (UCSC)	Хр. 6: 167.83 – 167.97 Mb	Хр. 17: 13.98 – 14.13 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AFDN (англ. Afadin, adherens junction formation factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 824 амінокислот, а молекулярна маса — 206 804.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAGGRDEER		RKLADIIHHW		NANRLDLFEI		SQPTEDLEFH		GVMRFYFQDK
AAGNFATKCI		RVSSTATTQD		VIETLAEKFR		PDMRMLSSPK		YSLYEVHVSG
ERRLDIDEKP		LVVQLNWNKD		DREGRFVLKN		ENDAIPPKKA		QSNGPEKQEK
EGVIQNFKRT		LSKKEKKEKK		KREKEALRQA		SDKDDRPFQG		EDVENSRLAA
EVYKDMPETS		FTRTISNPEV		VMKRRRQQKL		EKRMQEFRSS		DGRPDSGGTL
RIYADSLKPN		IPYKTILLST		TDPADFAVAE		ALEKYGLEKE		NPKDYCIARV
MLPPGAQHSD		EKGAKEIILD		DDECPLQIFR		EWPSDKGILV		FQLKRRPPDH
IPKKTKKHLE		GKTPKGKERA		DGSGYGSTLP		PEKLPYLVEL		SPGRRNHFAY
YNYHTYEDGS		DSRDKPKLYR		LQLSVTEVGT		EKLDDNSIQL		FGPGIQPHHC
DLTNMDGVVT		VTPRSMDAET		YVEGQRISET		TMLQSGMKVQ		FGASHVFKFV
DPSQDHALAK		RSVDGGLMVK		GPRHKPGIVQ		ETTFDLGGDI		HSGTALPTSK
STTRLDSDRV		SSASSTAERG		MVKPMIRVEQ		QPDYRRQESR		TQDASGPELI
LPASIEFRES		SEDSFLSAII		NYTNSSTVHF		KLSPTYVLYM		ACRYVLSNQY
RPDISPTERT		HKVIAVVNKM		VSMMEGVIQK		QKNIAGALAF		WMANASELLN
FIKQDRDLSR		ITLDAQDVLA		HLVQMAFKYL		VHCLQSELNN		YMPAFLDDPE
ENSLQRPKID		DVLHTLTGAM		SLLRRCRVNA		ALTIQLFSQL		FHFINMWLFN
RLVTDPDSGL		CSHYWGAIIR		QQLGHIEAWA		EKQGLELAAD		CHLSRIVQAT
TLLTMDKYAP		DDIPNINSTC		FKLNSLQLQA		LLQNYHCAPD		EPFIPTDLIE
NVVTVAENTA		DELARSDGRE		VQLEEDPDLQ		LPFLLPEDGY		SCDVVRNIPN
GLQEFLDPLC		QRGFCRLIPH		TRSPGTWTIY		FEGADYESHL		LRENTELAQP
LRKEPEIITV		TLKKQNGMGL		SIVAAKGAGQ		DKLGIYVKSV		VKGGAADVDG
RLAAGDQLLS		VDGRSLVGLS		QERAAELMTR		TSSVVTLEVA		KQGAIYHGLA
TLLNQPSPMM		QRISDRRGSG		KPRPKSEGFE		LYNNSTQNGS		PESPQLPWAE
YSEPKKLPGD		DRLMKNRADH		RSSPNVANQP		PSPGGKSAYA		SGTTAKITSV
STGNLCTEEQ		TPPPRPEAYP		IPTQTYTREY		FTFPASKSQD		RMAPPQNQWP
NYEEKPHMHT		DSNHSSIAIQ		RVTRSQEELR		EDKAYQLERH		RIEAAMDRKS
DSDMWINQSS		SLDSSTSSQE		HLNHSSKSVT		PASTLTKSGP		GRWKTPAAIP
ATPVAVSQPI		RTDLPPPPPP		PPVHYAGDFD		GMSMDLPLPP		PPSANQIGLP
SAQVAAAERR		KREEHQRWYE		KEKARLEEER		ERKRREQERK		LGQMRTQSLN
PAPFSPLTAQ		QMKPEKPSTL		QRPQETVIRE		LQPQQQPRTI		ERRDLQYITV
SKEELSSGDS		LSPDPWKRDA		KEKLEKQQQM		HIVDMLSKEI		QELQSKPDRS
AEESDRLRKL		MLEWQFQKRL		QESKQKDEDD		EEEEDDDVDT		MLIMQRLEAE
RRARLQDEER		RRQQQLEEMR		KREAEDRARQ		EEERRRQEEE		RTKRDAEEKR
RQEEGYYSRL		EAERRRQHDE		AARRLLEPEA		PGLCRPPLPR		DYEPPSPSPA
PGAPPPPPQR		NASYLKTQVL		SPDSLFTAKF		VAYNEEEEEE		DCSLAGPNSY
PGSTGAAVGA		HDACRDAKEK		RSKSQDADSP		GSSGAPENLT		FKERQRLFSQ
GQDVSNKVKA		SRKLTELENE		LNTK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинних контактах.

Література

• Takai Y., Nakanishi H. (2003). Nectin and afadin: novel organizers of intercellular junctions. J. Cell Sci. 116: 17—27. PMID 12456712 DOI:10.1242/jcs.00167

Див. також

• Хромосома 6