ALMS1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
ALMS1
Ідентифікатори
Символи ALMS1, ALSS, centrosome and basal body associated protein, ALMS1 centrosome and basal body associated protein
Зовнішні ІД OMIM: 606844 MGI: 1934606 HomoloGene: 49406 GeneCards: ALMS1
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_015120
NM_001378454
NM_145223
RefSeq (білок)
NP_055935
NP_660258
Локус (UCSC) Хр. 2: 73.39 – 73.63 Mb Хр. 6: 85.56 – 85.68 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ALMS1 (англ. ALMS1, centrosome and basal body associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 167 амінокислот, а молекулярна маса — 460 965[4]. При мутаціях цього гена може розвинутися синдром Алстрема.

Послідовність амінокислот
1020304050
MEPEDLPWPGELEEEEEEEEEEEEEEEEAAAAAAANVDDVVVVEEVEEEA
GRELDSDSHYGPQHLESIDDEEDEEAKAWLQAHPGRILPPLSPPQHRYSE
GERTSLEKIVPLTCHVWQQIVYQGNSRTQISDTNVVCLETTAQRGSGDDQ
KTESWHCLPQEMDSSQTLDTSQTRFNVRTEDTEVTDFPSLEEGILTQSEN
QVKEPNRDLFCSPLLVIQDSFASPDLPLLTCLTQDQEFAPDSLFHQSELS
FAPLRGIPDKSEDTEWSSRPSEVSEALFQATAEVASDLASSRFSVSQHPL
IGSTAVGSQCPFLPSEQGNNEETISSVDELKIPKDCDRYDDLCSYMSWKT
RKDTQWPENNLADKDQVSVATSFDITDENIATKRSDHFDAARSYGQYWTQ
EDSSKQAETYLTKGLQGKVESDVITLDGLNENAVVCSERVAELQRKPTRE
SEYHSSDLRMLRMSPDTVPKAPKHLKAGDTSKGGIAKVTQSNLKSGITTT
PVDSDIGSHLSLSLEDLSQLAVSSLETTTGQHTDTLNQKTLADTHLTEET
LKVTAIPEPADQKTATPTVLSSSHSHRGKPSIFYQQGLPDSHLTEEALKV
SAAPGLADQTTGMSTLTSTSYSHREKPGTFYQQELPESNLTEEPLEVSAA
PGPVEQKTGIPTVSSTSHSHVEDLLFFYRQTLPDGHLTDQALKVSAVSGP
ADQKTGTATVLSTPHSHREKPGIFYQQEFADSHQTEETLTKVSATPGPAD
QKTEIPAVQSSSYSQREKPSILYPQDLADSHLPEEGLKVSAVAGPADQKT
GLPTVPSSAYSHREKLLVFYQQALLDSHLPEEALKVSAVSGPADGKTGTP
AVTSTSSASSSLGEKPSAFYQQTLPNSHLTEEALKVSIVPGPGDQKTGIP
SAPSSFYSHREKPIIFSQQTLPDFLFPEEALKVSAVSVLAAQKTGTPTVS
SNSHSHSEKSSVFYQQELPDSDLPRESLKMSAIPGLTDQKTVPTPTVPSG
SFSHREKPSIFYQQEWPDSYATEKALKVSTGPGPADQKTEIPAVQSSSYP
QREKPSVLYPQVLSDSHLPEESLKVSAFPGPADQMTDTPAVPSTFYSQRE
KPGIFYQQTLPESHLPKEALKISVAPGLADQKTGTPTVTSTSYSQHREKP
SIFHQQALPGTHIPEEAQKVSAVTGPGNQKTWIPRVLSTFYSQREKPGIF
YQQTLPGSHIPEEAQKVSPVLGPADQKTGTPTPTSASYSHTEKPGIFYQQ
VLPDNHPTEEALKISVASEPVDQTTGTPAVTSTSYSQYREKPSIFYQQSL
PSSHLTEEAKNVSAVPGPADQKTVIPILPSTFYSHTEKPGVFYQQVLPHS
HPTEEALKISVASEPVDQTTGTPTVTSTSYSQHTEKPSIFYQQSLPGSHL
TEEAKNVSAVPGPGDRKTGIPTLPSTFYSHTEKPGSFYQQVLPHSHLPEE
ALEVSVAPGPVDQTIGTPTVTSPSSSFGEKPIVIYKQAFPEGHLPEESLK
VSVAPGPVGQTTGAPTITSPSYSQHRAKSGSFYQLALLGSQIPEEALRVS
SAPGPADQTTGIPTITSTSYSFGEKPIVNYKQAFPDGHLPEEALKVSIVS
GPTEKKTDIPAGPLGSSALGEKPITFYRQALLDSPLNKEVVKVSAAPGPA
DQKTETLPVHSTSYSNRGKPVIFYQQTLSDSHLPEEALKVPPVPGPDAQK
TETPSVSSSLYSYREKPIVFYQQALPDSELTQEALKVSAVPQPADQKTGL
STVTSSFYSHTEKPNISYQQELPDSHLTEEALKVSNVPGPADQKTGVSTV
TSTSYSHREKPIVSYQRELPHFTEAGLKILRVPGPADQKTGINILPSNSY
PQREHSVISYEQELPDLTEVTLKAIGVPGPADQKTGIQIASSSSYSNREK
ASIFHQQELPDVTEEALNVFVVPGQGDRKTEIPTVPLSYYSRREKPSVIS
QQELPDSHLTEEALKVSPVSIPAEQKTGIPIGLSSSYSHSHKEKLKISTV
HIPDDQKTEFPAATLSSYSQIEKPKISTVIGPNDQKTPSQTAFHSSYSQT
VKPNILFQQQLPDRDQSKGILKISAVPELTDVNTGKPVSLSSSYFHREKS
NIFSPQELPGSHVTEDVLKVSTIPGPAGQKTVLPTALPSSFSHREKPDIF
YQKDLPDRHLTEDALKISSALGQADQITGLQTVPSGTYSHGENHKLVSEH
VQRLIDNLNSSDSSVSSNNVLLNSQADDRVVINKPESAGFRDVGSEEIQD
AENSAKTLKEIRTLLMEAENMALKRCNFPAPLARFRDISDISFIQSKKVV
CFKEPSSTGVSNGDLLHRQPFTEESPSSRCIQKDIGTQTNLKCRRGIENW
EFISSTTVRSPLQEAESKVSMALEETLRQYQAAKSVMRSEPEGCSGTIGN
KIIIPMMTVIKSDSSSDASDGNGSCSWDSNLPESLESVSDVLLNFFPYVS
PKTSITDSREEEGVSESEDGGGSSVDSLAAHVKNLLQCESSLNHAKEILR
NAEEEESRVRAHAWNMKFNLAHDCGYSISELNEDDRRKVEEIKAELFGHG
RTTDLSKGLQSPRGMGCKPEAVCSHIIIESHEKGCFRTLTSEHPQLDRHP
CAFRSAGPSEMTRGRQNPSSCRAKHVNLSASLDQNNSHFKVWNSLQLKSH
SPFQNFIPDEFKISKGLRMPFDEKMDPWLSELVEPAFVPPKEVDFHSSSQ
MPSPEPMKKFTTSITFSSHRHSKCISNSSVVKVGVTEGSQCTGASVGVFN
SHFTEEQNPPRDLKQKTSSPSSFKMHSNSQDKEVTILAEGRRQSQKLPVD
FERSFQEEKPLERSDFTGSHSEPSTRANCSNFKEIQISDNHTLISMGRPS
STLGVNRSSSRLGVKEKNVTITPDLPSCIFLEQRELFEQSKAPRADDHVR
KHHSPSPQHQDYVAPDLPSCIFLEQRELFEQCKAPYVDHQMRENHSPLPQ
GQDSIASDLPSPISLEQCQSKAPGVDDQMNKHHFPLPQGQDCVVEKNNQH
KPKSHISNINVEAKFNTVVSQSAPNHCTLAASASTPPSNRKALSCVHITL
CPKTSSKLDSGTLDERFHSLDAASKARMNSEFNFDLHTVSSRSLEPTSKL
LTSKPVAQDQESLGFLGPKSSLDFQVVQPSLPDSNTITQDLKTIPSQNSQ
IVTSRQIQVNISDFEGHSNPEGTPVFADRLPEKMKTPLSAFSEKLSSDAV
TQITTESPEKTLFSSEIFINAEDRGHEIIEPGNQKLRKAPVKFASSSSVQ
QVTFSRGTDGQPLLLPYKPSGSTKMYYVPQLRQIPPSPDSKSDTTVESSH
SGSNDAIAPDFPAQVLGTRDDDLSATVNIKHKEGIYSKRVVTKASLPVGE
KPLQNENADASVQVLITGDENLSDKKQQEIHSTRAVTEAAQAKEKESLQK
DTADSSAAAAAEHSAQVGDPEMKNLPDTKAITQKEEIHRKKTVPEEAWPN
NKESLQINIEESECHSEFENTTRSVFRSAKFYIHHPVHLPSDQDICHESL
GKSVFMRHSWKDFFQHHPDKHREHMCLPLPYQNMDKTKTDYTRIKSLSIN
VNLGNKEVMDTTKSQVRDYPKHNGQISDPQRDQKVTPEQTTQHTVSLNEL
WNKYRERQRQQRQPELGDRKELSLVDRLDRLAKILQNPITHSLQVSESTH
DDSRGERSVKEWSGRQQQRNKLQKKKRFKSLEKSHKNTGELKKSKVLSHH
RAGRSNQIKIEQIKFDKYILSKQPGFNYISNTSSDCRPSEESELLTDTTT
NILSGTTSTVESDILTQTDREVALHERSSSVSTIDTARLIQAFGHERVCL
SPRRIKLYSSITNQQRRYLEKRSKHSKKVLNTGHPLVTSEHTRRRHIQVA
NHVISSDSISSSASSFLSSNSTFCNKQNVHMLNKGIQAGNLEIVNGAKKH
TRDVGITFPTPSSSEAKLEENSDVTSWSEEKREEKMLFTGYPEDRKLKKN
KKNSHEGVSWFVPVENVESRSKKENVPNTCGPGISWFEPITKTRPWREPL
REQNCQGQHLDGRGYLAGPGREAGRDLLRPFVRATLQESLQFHRPDFISR
SGERIKRLKLIVQERKLQSMLQTERDALFNIDRERQGHQNRMCPLPKRVF
LAIQKNKPISKKEMIQRSKRIYEQLPEVQKKREEEKRKSEYKSYRLRAQL
YKKRVTNQLLGRKVPWD

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.

Література[ред. | ред. код]

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки[ред. | ред. код]

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:428 (англ.) . Архів оригіналу за 28 жовтня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.
  4. UniProt, Q8TCU4 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.

Див. також[ред. | ред. код]