ANKRD27

ANKRD27
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4B93, 4CYM, 4CZ2
Ідентифікатори
Символи	ANKRD27, VARP, PP12899, ankyrin repeat domain 27
Зовнішні ІД	MGI: 2444103 HomoloGene: 12956 GeneCards: ANKRD27
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • guanyl-nucleotide exchange factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding Клітинна компонента • ендосома • late endosome • мембрана • Меланосома • клітинна мембрана • transport vesicle • tubular endosome • early endosome • лізосома • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • neuron projection Біологічний процес • negative regulation of SNARE complex assembly • early endosome to late endosome transport • positive regulation of dendrite morphogenesis • endosome to melanosome transport • protein transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • neuron projection morphogenesis • GO:0015915 транспорт • regulation of molecular function • positive regulation of neuron projection development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84079	245886
Ensembl	ENSG00000105186	ENSMUSG00000034867
UniProt	Q96NW4	Q3UMR0
RefSeq (мРНК)	NM_032139	NM_145633 NM_178263 NM_001358876
RefSeq (білок)	NP_115515	NP_663608 NP_839994 NP_001345805
Локус (UCSC)	Хр. 19: 32.6 – 32.68 Mb	Хр. 7: 35.29 – 35.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ANKRD27 (англ. Ankyrin repeat domain 27) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 050 амінокислот, а молекулярна маса — 116 984.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALYDEDLLK		NPFYLALQKC		RPDLCSKVAQ		IHGIVLVPCK		GSLSSSIQST
CQFESYILIP		VEEHFQTLNG		KDVFIQGNRI		KLGAGFACLL		SVPILFEETF
YNEKEESFSI		LCIAHPLEKR		ESSEEPLAPS		DPFSLKTIED		VREFLGRHSE
RFDRNIASFH		RTFRECERKS		LRHHIDSANA		LYTKCLQQLL		RDSHLKMLAK
QEAQMNLMKQ		AVEIYVHHEI		YNLIFKYVGT		MEASEDAAFN		KITRSLQDLQ
QKDIGVKPEF		SFNIPRAKRE		LAQLNKCTSP		QQKLVCLRKV		VQLITQSPSQ
RVNLETMCAD		DLLSVLLYLL		VKTEIPNWMA		NLSYIKNFRF		SSLAKDELGY
CLTSFEAAIE		YIRQGSLSAK		PPESEGFGDR		LFLKQRMSLL		SQMTSSPTDC
LFKHIASGNQ		KEVERLLSQE		DHDKDTVQKM		CHPLCFCDDC		EKLVSGRLND
PSVVTPFSRD		DRGHTPLHVA		AVCGQASLID		LLVSKGAMVN		ATDYHGATPL
HLACQKGYQS		VTLLLLHYKA		SAEVQDNNGN		TPLHLACTYG		HEDCVKALVY
YDVESCRLDI		GNEKGDTPLH		IAARWGYQGV		IETLLQNGAS		TEIQNRLKET
PLKCALNSKI		LSVMEAYHLS		FERRQKSSEA		PVQSPQRSVD		SISQESSTSS
FSSMSASSRQ		EETKKDYREV		EKLLRAVADG		DLEMVRYLLE		WTEEDLEDAE
DTVSAADPEF		CHPLCQCPKC		APAQKRLAKV		PASGLGVNVT		SQDGSSPLHV
AALHGRADLI		PLLLKHGANA		GARNADQAVP		LHLACQQGHF		QVVKCLLDSN
AKPNKKDLSG		NTPLIYACSG		GHHELVALLL		QHGASINASN		NKGNTALHEA
VIEKHVFVVE		LLLLHGASVQ		VLNKRQRTAV		DCAEQNSKIM		ELLQVVPSCV
ASLDDVAETD		RKEYVTVKIR		KKWNSKLYDL		PDEPFTRQFY		FVHSAGQFKG
KTSREIMARD		RSVPNLTEGS		LHEPGRQSVT		LRQNNLPAQS		GSHAAEKGNS
DWPERPGLTQ		TGPGHRRMLR		RHTVEDAVVS		QGPEAAGPLS		TPQEVSASRS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang X., He X., Fu X.-Y., Chang Z. (2006). Varp is a Rab21 guanine nucleotide exchange factor and regulates endosome dynamics. J. Cell Sci. 119: 1053—1062. PMID 16525121 DOI:10.1242/jcs.02810
• Nottingham R.M., Ganley I.G., Barr F.A., Lambright D.G., Pfeffer S.R. (2011). RUTBC1 protein, a Rab9A effector that activates GTP hydrolysis by Rab32 and Rab33B proteins. J. Biol. Chem. 286: 33213—33222. PMID 21808068 DOI:10.1074/jbc.M111.261115

Див. також

• Хромосома 19