APBB1IP

APBB1IP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MWN, 3ZDL
Ідентифікатори
Символи	APBB1IP, amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 1 interacting protein, INAG1, PREL1, RARP1, RIAM, amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 609036 MGI: 1861354 HomoloGene: 32434 GeneCards: APBB1IP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • міжклітинні контакти • cell projection • T cell receptor complex • цитоскелет • мембрана • focal adhesion • lamellipodium • гіалоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • T cell activation via T cell receptor contact with antigen bound to MHC molecule on antigen presenting cell • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54518	54519
Ensembl	ENSG00000077420	ENSMUSG00000026786
UniProt	Q7Z5R6	Q8R5A3
RefSeq (мРНК)	NM_019043	NM_019456
RefSeq (білок)	NP_061916	NP_062329
Локус (UCSC)	Хр. 10: 26.44 – 26.57 Mb	Хр. 2: 22.66 – 22.77 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

APBB1IP (англ. Amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 666 амінокислот, а молекулярна маса — 73 183.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGESSEDIDQ		MFSTLLGEMD		LLTQSLGVDT		LPPPDPNPPR		AEFNYSVGFK
DLNESLNALE		DQDLDALMAD		LVADISEAEQ		RTIQAQKESL		QNQHHSASLQ
ASIFSGAASL		GYGTNVAATG		ISQYEDDLPP		PPADPVLDLP		LPPPPPEPLS
QEEEEAQAKA		DKIKLALEKL		KEAKVKKLVV		KVHMNDNSTK		SLMVDERQLA
RDVLDNLFEK		THCDCNVDWC		LYEIYPELQI		ERFFEDHENV		VEVLSDWTRD
TENKILFLEK		EEKYAVFKNP		QNFYLDNRGK		KESKETNEKM		NAKNKESLLE
ESFCGTSIIV		PELEGALYLK		EDGKKSWKRR		YFLLRASGIY		YVPKGKTKTS
RDLACFIQFE		NVNIYYGTQH		KMKYKAPTDY		CFVLKHPQIQ		KESQYIKYLC
CDDTRTLNQW		VMGIRIAKYG		KTLYDNYQRA		VAKAGLASRW		TNLGTVNAAA
PAQPSTGPKT		GTTQPNGQIP		QATHSVSAVL		QEAQRHAETS		KDKKPALGNH
HDPAVPRAPH		APKSSLPPPP		PVRRSSDTSG		SPATPLKAKG		TGGGGLPAPP
DDFLPPPPPP		PPLDDPELPP		PPPDFMEPPP		DFVPPPPPSY		AGIAGSELPP
PPPPPPAPAP		APVPDSARPP		PAVAKRPPVP		PKRQENPGHP		GGAGGGEQDF
MSDLMKALQK		KRGNVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

• Jenzora A., Behrendt B., Small J.V., Wehland J., Stradal T.E. (2005). PREL1 provides a link from Ras signalling to the actin cytoskeleton via Ena/VASP proteins. FEBS Lett. 579: 455—463. PMID 15642358 DOI:10.1016/j.febslet.2004.10.110
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 10