APC2

APC2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1DEB, 1EMU, 1JPP, 1M5I, 1T08, 1TH1, 1V18, 2RQU, 3AU3, 3NMW, 3NMX, 3NMZ, 3QHE, 3RL7, 3RL8, 3T7U, 4G69
Ідентифікатори
Символи	APC2, APCL, adenomatosis polyposis coli 2, WNT signaling pathway regulator, APC regulator of WNT signaling pathway 2, MRT74
Зовнішні ІД	OMIM: 612034 MGI: 1346052 HomoloGene: 4299 GeneCards: APC2
Пов'язані генетичні захворювання
Sotos syndrome 3
Онтологія гена Молекулярна функція • beta-catenin binding • microtubule binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • gamma-catenin binding Клітинна компонента • цитоплазма • комплекс Ґольджі • microtubule cytoskeleton • мікрофіламент • perinuclear region of cytoplasm • cytoplasmic microtubule • catenin complex • мікротрубочка • цитоскелет • lamellipodium membrane • filamentous actin • гіалоплазма • midbody • intercellular bridge • beta-catenin destruction complex • postsynapse Біологічний процес • negative regulation of Wnt signaling pathway • Wnt signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • microtubule cytoskeleton organization • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • cell fate specification • negative regulation of microtubule depolymerization • pattern specification process • cell migration • регуляція диференціювання клітин • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10297	23805
Ensembl	ENSG00000115266	ENSMUSG00000020135
UniProt	O95996	Q9Z1K7
RefSeq (мРНК)	NM_005883 NM_001351273	NM_011789 NM_001372237 NM_001372238 NM_001372239 NM_001372240 NM_001372241
RefSeq (білок)	NP_005874 NP_001338202	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 19: 1.45 – 1.47 Mb	Хр. 10: 80.13 – 80.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

APC2 (англ. APC2, WNT signaling pathway regulator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 303 амінокислот, а молекулярна маса — 243 949.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSVAPYEQ		LVRQVEALKA		ENSHLRQELR		DNSSHLSKLE		TETSGMKEVL
KHLQGKLEQE		ARVLVSSGQT		EVLEQLKALQ		MDITSLYNLK		FQPPTLGPEP
AARTPEGSPV		HGSGPSKDSF		GELSRATIRL		LEELDRERCF		LLNEIEKEEK
EKLWYYSQLQ		GLSKRLDELP		HVETQFSMQM		DLIRQQLEFE		AQHIRSLMEE
RFGTSDEMVQ		RAQIRASRLE		QIDKELLEAQ		DRVQQTEPQA		LLAVKSVPVD
EDPETEVPTH		PEDGTPQPGN		SKVEVVFWLL		SMLATRDQED		TARTLLAMSS
SPESCVAMRR		SGCLPLLLQI		LHGTEAAAGG		RAGAPGAPGA		KDARMRANAA
LHNIVFSQPD		QGLARKEMRV		LHVLEQIRAY		CETCWDWLQA		RDGGPEGGGA
GSAPIPIEPQ		ICQATCAVMK		LSFDEEYRRA		MNELGGLQAV		AELLQVDYEM
HKMTRDPLNL		ALRRYAGMTL		TNLTFGDVAN		KATLCARRGC		MEAIVAQLAS
DSEELHQVVS		SILRNLSWRA		DINSKKVLRE		AGSVTALVQC		VLRATKESTL
KSVLSALWNL		SAHSTENKAA		ICQVDGALGF		LVSTLTYKCQ		SNSLAIIESG
GGILRNVSSL		VATREDYRQV		LRDHNCLQTL		LQHLTSHSLT		IVSNACGTLW
NLSARSARDQ		ELLWDLGAVG		MLRNLVHSKH		KMIAMGSAAA		LRNLLAHRPA
KHQAAATAVS		PGSCVPSLYV		RKQRALEAEL		DARHLAQALE		HLEKQGPPAA
EAATKKPLPP		LRHLDGLAQD		YASDSGCFDD		DDAPSSLAAA		AATGEPASPA
ALSLFLGSPF		LQGQALARTP		PTRRGGKEAE		KDTSGEAAVA		AKAKAKLALA
VARIDQLVED		ISALHTSSDD		SFSLSSGDPG		QEAPREGRAQ		SCSPCRGPEG
GRREAGSRAH		PLLRLKAAHA		SLSNDSLNSG		SASDGYCPRE		HMLPCPLAAL
ASRREDPRCG		QPRPSRLDLD		LPGCQAEPPA		REATSADARV		RTIKLSPTYQ
HVPLLEGASR		AGAEPLAGPG		ISPGARKQAW		LPADHLSKVP		EKLAAAPLSV
ASKALQKLAA		QEGPLSLSRC		SSLSSLSSAG		RPGPSEGGDL		DDSDSSLEGL
EEAGPSEAEL		DSTWRAPGAT		SLPVAIPAPR		RNRGRGLGVE		DATPSSSSEN
YVQETPLVLS		RCSSVSSLGS		FESPSIASSI		PSEPCSGQGS		GTISPSELPD
SPGQTMPPSR		SKTPPLAPAP		QGPPEATQFS		LQWESYVKRF		LDIADCRERC
RLPSELDAGS		VRFTVEKPDE		NFSCASSLSA		LALHEHYVQQ		DVELRLLPSA
CPERGGGAGG		AGLHFAGHRR		REEGPAPTGS		RPRGAADQEL		ELLRECLGAA
VPARLRKVAS		ALVPGRRALP		VPVYMLVPAP		APAQEDDSCT		DSAEGTPVNF
SSAASLSDET		LQGPPRDQPG		GPAGRQRPTG		RPTSARQAMG		HRHKAGGAGR
SAEQSRGAGK		NRAGLELPLG		RPPSAPADKD		GSKPGRTRGD		GALQSLCLTT
PTEEAVYCFY		GNDSDEEPPA		AAPTPTHRRT		SAIPRAFTRE		RPQGRKEAPA
PSKAAPAAPP		PARTQPSLIA		DETPPCYSLS		SSASSLSEPE		PSEPPAVHPR
GREPAVTKDP		GPGGGRDSSP		SPRAAEELLQ		RCISSALPRR		RPPVSGLRRR
KPRATRLDER		PAEGSRERGE		EAAGSDRASD		LDSVEWRAIQ		EGANSIVTWL
HQAAAATREA		SSESDSILSF		VSGLSVGSTL		QPPKHRKGRQ		AEGEMGSARR
PEKRGAASVK		TSGSPRSPAG		PEKPRGTQKT		TPGVPAVLRG		RTVIYVPSPA
PRAQPKGTPG		PRATPRKVAP		PCLAQPAAPA		KVPSPGQQRS		RSLHRPAKTS
ELATLSQPPR		SATPPARLAK		TPSSSSSQTS		PASQPLPRKR		PPVTQAAGAL
PGPGASPVPK		TPARTLLAKQ		HKTQRSPVRI		PFMQRPARRG		PPPLARAVPE
PGPRGRAGTE		AGPGARGGRL		GLVRVASALS		SGSESSDRSG		FRRQLTFIKE
SPGLRRRRSE		LSSAESAASA		PQGASPRRGR		PALPAVFLCS		SRCEELRAAP
RQGPAPARQR		PPAARPSPGE		RPARRTTSES		PSRLPVRAPA		ARPETVKRYA
SLPHISVARR		PDGAVPAAPA		SADAARRSSD		GEPRPLPRVA		APGTTWRRIR
DEDVPHILRS		TLPATALPLR		GSTPEDAPAG		PPPRKTSDAV		VQTEEVAAPK
TNSSTSPSLE		TREPPGAPAG		GQLSLLGSDV		DGPSLAKAPI		SAPFVHEGLG
VAVGGFPASR		HGSPSRSARV		PPFNYVPSPM		VVAATTDSAA		EKAPATASAT
LLE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, апараті гольджі.

Література

• Nakagawa H., Koyama K., Monden M., Nakamura Y. (1999). Analysis of APCL, a brain-specific adenomatous polyposis coli homologue, for mutations and expression in brain tumors. Jpn. J. Cancer Res. 90: 982—986. PMID 10551328 DOI:10.1111/j.1349-7006.1999.tb00845.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19