ARAP1

ARAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4X1V
Ідентифікатори
Символи	ARAP1, CENTD2, ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 1, cnt-d2
Зовнішні ІД	OMIM: 606646 MGI: 1916960 HomoloGene: 12326 GeneCards: ARAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding • type 1 angiotensin receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi cisterna membrane • trans-Golgi network • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • actin filament reorganization involved in cell cycle • regulation of cell shape • negative regulation of stress fiber assembly • regulation of small GTPase mediated signal transduction • positive regulation of filopodium assembly • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of receptor recycling • positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	116985	69710
Ensembl	ENSG00000186635	ENSMUSG00000032812
UniProt	Q96P48	Q4LDD4
RefSeq (мРНК)	NM_015242 NM_001040118 NM_001135190 NM_001369489	NM_001040111 NM_001040112 NM_027180 NM_198096
RefSeq (білок)	NP_001035207 NP_001128662 NP_056057 NP_001356418	NP_001035200 NP_001035201 NP_081456 NP_932764 NP_001394730 NP_001394732
Локус (UCSC)	Хр. 11: 72.69 – 72.79 Mb	Хр. 7: 101 – 101.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARAP1 (англ. ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 450 амінокислот, а молекулярна маса — 162 192.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEAGDAALS		VAEWLRALHL		EQYTGLFEQH		GLVWATECQG		LSDTRLMDMG
MLLPGHRRRI		LAGLLRAHTS		PAPAPRPTPR		PVPMKRHIFR		SPPVPATPPE
PLPTTTEDEG		LPAAPPIPPR		RSCLPPTCFT		TPSTAAPDPV		LPPLPAKRHL
AELSVPPVPP		RTGPPRLLVS		LPTKEEESLL		PSLSSPPQPQ		SEEPLSTLPQ
GPPQPPSPPP		CPPEIPPKPV		RLFPEFDDSD		YDEVPEEGPG		APARVMTKKE
EPPPSRVPRA		VRVASLLSEG		EELSGDDQGD		EEEDDHAYEG		VPNGGWHTSS
LSLSLPSTIA		APHPMDGPPG		GSTPVTPVIK		AGWLDKNPPQ		GSYIYQKRWV
RLDTDHLRYF		DSNKDAYSKR		FISVACISHV		AAIGDQKFEV		ITNNRTFAFR
AESDVERKEW		MQALQQAMAE		QRARARLSSA		YLLGVPGSEQ		PDRAGSLELR
GFKNKLYVAV		VGDKVQLYKN		LEEYHLGIGI		TFIDMSVGNV		KEVDRRSFDL
TTPYRIFSFS		ADSELEKEQW		LEAMQGAIAE		ALSTSEVAER		IWAAAPNRFC
ADCGAPQPDW		ASINLCVVIC		KRCAGEHRGL		GAGVSKVRSL		KMDRKVWTET
LIELFLQLGN		GAGNRFWAAN		VPPSEALQPS		SSPSTRRCHL		EAKYREGKYR
RYHPLFGNQE		ELDKALCAAV		TTTDLAETQA		LLGCGAGINC		FSGDPEAPTP
LALAEQAGQT		LQMEFLRNNR		TTEVPRLDSM		KPLEKHYSVV		LPTVSHSGFL
YKTASAGKLL		QDRRAREEFS		RRWCVLGDGV		LSYFENERAV		TPNGEIRASE
IVCLAVPPPD		THGFEHTFEV		YTEGERLYLF		GLESAEQAHE		WVKCIAKAFV
PPLAEDLLAR		DFERLGRLPY		KAGLSLQRAQ		EGWFSLSGSE		LRAVFPEGPC
EEPLQLRKLQ		ELSIQGDSEN		QVLVLVERRR		TLYIQGERRL		DFMGWLGAIQ
KAAASMGDTL		SEQQLGDSDI		PVIVYRCVDY		ITQCGLTSEG		IYRKCGQTSK
TQRLLESLRQ		DARSVHLKEG		EQHVDDVSSA		LKRFLRDLPD		GLFTRAQRLT
WLEASEIEDE		EEKVSRYREL		LVRLPPVNRA		TVKALISHLY		CVQCFSDTNQ
MNVHNLAIVF		GPTLFQTDGQ		DYKAGRVVED		LINHYVVVFS		VDEEELRKQR
EEITAIVKMR		VAGTASGTQH		AGDFICTVYL		EEKKAETEQH		IKVPASMTAE
ELTLEILDRR		NVGIREKDYW		TCFEVNEREE		AERPLHFAEK		VLPILHGLGT
DSHLVVKKHQ		AMEAMLLYLA		SRVGDTKHGM		MKFREDRSLL		GLGLPSGGFH
DRYFILNSSC		LRLYKEVRSQ		RPWSGAPETS		HRPEKEWPIK		SLKVYLGVKK
KLRPPTCWGF		TVVHETEKHE		KQQWYLCCDT		QMELREWFAT		FLFVQHDGLV
WPSEPSRVSR		AVPEVRLGSV		SLIPLRGSEN		EMRRSVAAFT		ADPLSLLRNV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Simova S., Klima M., Cermak L., Sourkova V., Andera L. (2008). Arf and Rho GAP adapter protein ARAP1 participates in the mobilization of TRAIL-R1/DR4 to the plasma membrane. Apoptosis. 13: 423—436. PMID 18165900 DOI:10.1007/s10495-007-0171-8

Див. також

• Хромосома 11