Архаїн-1

Архаїн-1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5A1U, 5A1V, 5A1W, 5A1X, 5A1Y
Ідентифікатори
Символи	ARCN1, COPD, archain 1, SRMMD
Зовнішні ІД	OMIM: 600820 MGI: 2387591 HomoloGene: 1250 GeneCards: ARCN1
Пов'язані генетичні захворювання
short stature, rhizomelic, with microcephaly, micrognathia, and developmental delay; SRMMD
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • мембрана • Golgi membrane • COPI-coated vesicle membrane • transport vesicle • ендоплазматичний ретикулум • COPI vesicle coat • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • COPI-coated vesicle • endoplasmic reticulum membrane • цитоплазма • комплекс Ґольджі Біологічний процес • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • cerebellar Purkinje cell layer maturation • adult locomotory behavior • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • Golgi vesicle transport • protein transport • pigmentation • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport • GO:0015915 транспорт • Golgi localization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	372	213827
Ensembl	ENSG00000095139	ENSMUSG00000032096
UniProt	P48444	Q5XJY5
RefSeq (мРНК)	NM_001142281 NM_001655	NM_145985
RefSeq (білок)	NP_001135753 NP_001646	NP_666097
Локус (UCSC)	Хр. 11: 118.57 – 118.6 Mb	Хр. 9: 44.65 – 44.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Архаїн-1 (англ. Archain 1) — білок, який кодується геном ARCN1, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 511 амінокислот, а молекулярна маса — 57 210.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVLLAAAVCT		KAGKAIVSRQ		FVEMTRTRIE		GLLAAFPKLM		NTGKQHTFVE
TESVRYVYQP		MEKLYMVLIT		TKNSNILEDL		ETLRLFSRVI		PEYCRALEEN
EISEHCFDLI		FAFDEIVALG		YRENVNLAQI		RTFTEMDSHE		EKVFRAVRET
QEREAKAEMR		RKAKELQQAR		RDAERQGKKA		PGFGGFGSSA		VSGGSTAAMI
TETIIETDKP		KVAPAPARPS		GPSKALKLGA		KGKEVDNFVD		KLKSEGETIM
SSSMGKRTSE		ATKMHAPPIN		MESVHMKIEE		KITLTCGRDG		GLQNMELHGM
IMLRISDDKY		GRIRLHVENE		DKKGVQLQTH		PNVDKKLFTA		ESLIGLKNPE
KSFPVNSDVG		VLKWRLQTTE		ESFIPLTINC		WPSESGNGCD		VNIEYELQED
NLELNDVVIT		IPLPSGVGAP		VIGEIDGEYR		HDSRRNTLEW		CLPVIDAKNK
SGSLEFSIAG		QPNDFFPVQV		SFVSKKNYCN		IQVTKVTQVD		GNSPVRFSTE
TTFLVDKYEI		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті Гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11