ARHGAP1

ARHGAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1AM4, 1GRN, 1OW3, 1RGP, 1TX4, 2NGR
Ідентифікатори
Символи	ARHGAP1, CDC42GAP, RHOGAP, RHOGAP1, p50rhoGAP, Rho GTPase activating protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602732 MGI: 2445003 HomoloGene: 20909 GeneCards: ARHGAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • SH3 domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • cadherin binding Клітинна компонента • гіалоплазма • екзосома • цитоплазма • endosome membrane • perinuclear region of cytoplasm • sorting endosome • мембрана • integral component of membrane Біологічний процес • regulation of small GTPase mediated signal transduction • Rho protein signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • small GTPase mediated signal transduction • positive regulation of signal transduction • transferrin transport • iron ion import across cell outer membrane • negative regulation of endocytic recycling • endosomal transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	392	228359
Ensembl	ENSG00000175220	ENSMUSG00000027247
UniProt	Q07960	Q5FWK3
RefSeq (мРНК)	NM_004308	NM_001145902 NM_146124 NM_001359970
RefSeq (білок)	NP_004299	NP_001139374 NP_666236 NP_001346899
Локус (UCSC)	Хр. 11: 46.68 – 46.7 Mb	Хр. 2: 91.48 – 91.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARHGAP1 (англ. Rho GTPase activating protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439 амінокислот, а молекулярна маса — 50 436.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPLSELQDD		LTLDDTSEAL		NQLKLASIDE		KNWPSDEMPD		FPKSDDSKSS
SPELVTHLKW		DDPYYDIARH		QIVEVAGDDK		YGRKIIVFSA		CRMPPSHQLD
HSKLLGYLKH		TLDQYVESDY		TLLYLHHGLT		SDNKPSLSWL		RDAYREFDRK
YKKNIKALYI		VHPTMFIKTL		LILFKPLISF		KFGQKIFYVN		YLSELSEHVK
LEQLGIPRQV		LKYDDFLKST		QKSPATAPKP		MPPRPPLPNQ		QFGVSLQHLQ
EKNPEQEPIP		IVLRETVAYL		QAHALTTEGI		FRRSANTQVV		REVQQKYNMG
LPVDFDQYNE		LHLPAVILKT		FLRELPEPLL		TFDLYPHVVG		FLNIDESQRV
PATLQVLQTL		PEENYQVLRF		LTAFLVQISA		HSDQNKMTNT		NLAVVFGPNL
LWAKDAAITL		KAINPINTFT		KFLLDHQGEL		FPSPDPSGL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Garrett M.D., Major G.N., Totty N., Hall A. (1991). Purification and N-terminal sequence of the p21rho GTPase-activating protein, rho GAP. Biochem. J. 276: 833—836. PMID 1905930 DOI:10.1042/bj2760833
• Mingot J.-M., Bohnsack M.T., Jaekle U., Goerlich D. (2004). Exportin 7 defines a novel general nuclear export pathway. EMBO J. 23: 3227—3236. PMID 15282546 DOI:10.1038/sj.emboj.7600338

Див. також

• Хромосома 11