ARHGAP20

ARHGAP20
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3MSX
Ідентифікатори
Символи	ARHGAP20, RARHOGAP, Rho GTPase activating protein 20
Зовнішні ІД	OMIM: 609568 MGI: 2445175 HomoloGene: 18938 GeneCards: ARHGAP20
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57569	244867
Ensembl	ENSG00000137727	ENSMUSG00000053199
UniProt	Q9P2F6	Q6IFT4
RefSeq (мРНК)	NM_001258415 NM_001258416 NM_001258417 NM_001258418 NM_020809 NM_001384657	NM_175535
RefSeq (білок)	NP_001245344 NP_001245345 NP_001245346 NP_001245347 NP_065860	NP_780744
Локус (UCSC)	Хр. 11: 110.58 – 110.71 Mb	Хр. 9: 51.68 – 51.77 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARHGAP20 (англ. Rho GTPase activating protein 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 191 амінокислот, а молекулярна маса — 132 608.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAMSPQQET		LGGQPGRSSS		LTGVSRLAGG		SCTKKKMKTL		AERRRSAPSL
ILDKALQKRP		TTRDSPSASV		DTCTFLSSLV		CSNRTLLIDG		RAELKRGLQR
QERHLFLFND		LFVVAKIKYN		NNFKIKNKIK		LTDMWTASCV		DEVGEGNTNA
MKSFVLGWPT		VNFVATFSSP		EQKDKWLSLL		QRYINLEKEK		DYPKSIPLKI
FAKDIGNCAY		SKTITVMNSD		TANEVINMSL		PMLGITGSER		DYQLWVNSGK
EEAPYPLIGH		EYPYGIKMSH		LRDSALLTPG		SKDSTTPFNL		QEPFLMEQLP
REMQCQFILK		PSRLAAAQQL		SDSGHKTFKR		RRSIINWAFW		RGSSTHLDNL
PSSPTSPMPG		QLFGISLPNI		CENDNLPKPV		LDMLFFLNQK		GPLTKGIFRQ
SANVKSCREL		KEKLNSGVEV		HLDCESIFVI		ASVLKDFLRN		IPGSIFSSDL
YDHWVSVMDQ		GNDEEKINTV		QRLLDQLPRA		NVVLLRYLFG		VLHNIEQHSS
SNQMTAFNLA		VCVAPSILWP		PASSSPELEN		EFTKKVSLLI		QFLIENCLRI
FGEEITSLFR		EVSVRCDTRE		NASDISCFQL		NDSSYDSLEN		ELNEDVDAPC
SDLVKKLGQG		SRSMDSVLTL		SDYDLDQPEV		EGLLTLSDFD		LAHSKDEDVQ
MKRPLESKPV		NILVYTKIPL		RDHARAPSAM		CTPSYLSTAA		ANAAKSLRRH
RRCSEPSIDY		LDSKLSYLRE		FYQKKLRKSS		CDAILSQKDE		DYLKQNQPLQ
EEGKTCFKQS		LVTGTDVSKK		NATTQNTKKK		SLSGSEGNHV		KLFPKSKPVA
ISVASYSPMS		SQDHSKNQPF		DVNTSGYSPP		HTADALKGPR		THRRCSEPNI
EDQNRKLTYL		RGIYSKKQHK		TSCEAGLLHG		EEDYLKRHKS		LQMEGQKLIN
QSLVMGIEVG		KSSATNQNTE		KVLPPRLNLC		PRTSYSSLSS		PGTSPSGSSV
SSQDSAFSQI		SEHSVFTPTE		TSSPIDCTFQ		AQRKREDLSP		DFSNASHVSG
MPGPSSGQAC		SRPAYTKKDT		MEWHSQMHSV		TLHPSTWLRN		GVASLKNWSL
KKKAKAARPE		EEKIASPKGP		LEPPPHASGV		PEANSLQEEQ		KDLPLRAAEG
LSPVQSAQRC		SSSPFQDSER		HCSSPFSLVE		SRLKLCMKSH		EEIEPGSQSS
SGSLPWERAS		ASSWTLEDAT		SPDSGPTVVC		DIEDRYLTKD		I

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Katoh M., Katoh M. (2003). Identification and characterization of human KIAA1391 and mouse Kiaa1391 genes encoding novel RhoGAP family proteins with RA domain and ANXL repeats. Int. J. Oncol. 23: 1471—1476. PMID 14532992

Див. також

• Хромосома 11