ARHGEF1

ARHGEF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1IAP, 1SHZ, 3AB3, 3ODO, 3ODW, 3ODX, 3P6A
Ідентифікатори
Символи	ARHGEF1, GEF1, LBCL2, LSC, P115-RHOGEF, SUB1.5, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, IMD62
Зовнішні ІД	OMIM: 601855 MGI: 1353510 HomoloGene: 3454 GeneCards: ARHGEF1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • RNA binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • G protein-coupled receptor binding Клітинна компонента • клітинна мембрана • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • проліферація • regulation of Rho protein signal transduction • Rho protein signal transduction • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of apoptotic process • regulation of small GTPase mediated signal transduction • G protein-coupled receptor signaling pathway • regulation of molecular function Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9138	16801
Ensembl	ENSG00000076928	ENSMUSG00000040940
UniProt	Q92888	Q61210
RefSeq (мРНК)	NM_004706 NM_198977 NM_199002	NM_001130150 NM_001130151 NM_001130152 NM_001130153 NM_008488
RefSeq (білок)	NP_004697 NP_945328 NP_945353	NP_001123622 NP_001123623 NP_001123624 NP_001123625 NP_032514
Локус (UCSC)	Хр. 19: 41.88 – 41.93 Mb	Хр. 7: 24.6 – 24.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARHGEF1 (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 912 амінокислот, а молекулярна маса — 102 435.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEDFARGAAS		PGPSRPGLVP		VSIIGAEDED		FENELETNSE		EQNSQFQSLE
QVKRRPAHLM		ALLQHVALQF		EPGPLLCCLH		ADMLGSLGPK		EAKKAFLDFY
HSFLEKTAVL		RVPVPPNVAF		ELDRTRADLI		SEDVQRRFVQ		EVVQSQQVAV
GRQLEDFRSK		RLMGMTPWEQ		ELAQLEAWVG		RDRASYEARE		RHVAERLLMH
LEEMQHTIST		DEEKSAAVVN		AIGLYMRHLG		VRTKSGDKKS		GRNFFRKKVM
GNRRSDEPAK		TKKGLSSILD		AARWNRGEPQ		VPDFRHLKAE		VDAEKPGATD
RKGGVGMPSR		DRNIGAPGQD		TPGVSLHPLS		LDSPDREPGA		DAPLELGDSS
PQGPMSLESL		APPESTDEGA		ETESPEPGDE		GEPGRSGLEL		EPEEPPGWRE
LVPPDTLHSL		PKSQVKRQEV		ISELLVTEAA		HVRMLRVLHD		LFFQPMAECL
FFPLEELQNI		FPSLDELIEV		HSLFLDRLMK		RRQESGYLIE		EIGDVLLARF
DGAEGSWFQK		ISSRFCSRQS		FALEQLKAKQ		RKDPRFCAFV		QEAESRPRCR
RLQLKDMIPT		EMQRLTKYPL		LLQSIGQNTE		EPTEREKVEL		AAECCREILH
HVNQAVRDME		DLLRLKDYQR		RLDLSHLRQS		SDPMLSEFKN		LDITKKKLVH
EGPLTWRVTK		DKAVEVHVLL		LDDLLLLLQR		QDERLLLKSH		SRTLTPTPDG
KTMLRPVLRL		TSAMTREVAT		DHKAFYVLFT		WDQEAQIYEL		VAQTVSERKN
WCALITETAG		SLKVPAPASR		PKPRPSPSST		REPLLSSSEN		GNGGRETSPA
DARTERILSD		LLPFCRPGPE		GQLAATALRK		VLSLKQLLFP		AEEDNGAGPP
RDGDGVPGGG		PLSPARTQEI		QENLLSLEET		MKQLEELEEE		FCRLRPLLSQ
LGGNSVPQPG		CT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Aasheim H.-C., Pedeutour F., Smeland E.B. (1997). Characterization, expression and chromosomal localization of a human gene homologous to the mouse Lsc oncogene, with strongest expression in hematopoetic tissues. Oncogene. 14: 1747—1752. PMID 9135076 DOI:10.1038/sj.onc.1200994
• Bhattacharyya R., Wedegaertner P.B. (2000). Galpha 13 requires palmitoylation for plasma membrane localization, Rho-dependent signaling, and promotion of p115-RhoGEF membrane binding. J. Biol. Chem. 275: 14992—14999. PMID 10747909 DOI:10.1074/jbc.M000415200
• Holinstat M., Mehta D., Kozasa T., Minshall R.D., Malik A.B. (2003). PKCa-induced p115RhoGEF phosphorylation signals endothelial cytoskeletal rearrangement. J. Biol. Chem. 278: 28793—28798. PMID 12754211 DOI:10.1074/jbc.M303900200
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Chen Z., Wells C.D., Sternweis P.C., Sprang S.R. (2001). Structure of the rgRGS domain of p115RhoGEF. Nat. Struct. Biol. 8: 805—809. PMID 11524686 DOI:10.1038/nsb0901-805

Див. також

• Хромосома 19