ATG3

ATG3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4NAW
Ідентифікатори
Символи	ATG3, APG3-LIKE, APG3, autophagy related 3, APG3L, PC3-96
Зовнішні ІД	OMIM: 609606 MGI: 1915091 HomoloGene: 6836 GeneCards: ATG3
Пов'язані генетичні захворювання
	бронхіальна астма
Онтологія гена
Молекулярна функція	• ubiquitin-like protein transferase activity; • enzyme binding; • Atg12 transferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • Atg8 ligase activity; • transferase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • cytoplasmic ubiquitin ligase complex;
Біологічний процес	• regulation of cilium assembly; • mitochondrial fragmentation involved in apoptotic process; • автофагія; • protein transport; • autophagy of nucleus; • autophagy of mitochondrion; • autophagosome assembly; • Убіквітин-залежний протеоліз; • protein targeting to membrane; • macroautophagy; • negative regulation of phagocytosis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	64422
	67841
	ENSG00000144848
	ENSMUSG00000022663
	Q9NT62
	Q9CPX6
	NM_001278712; NM_022488
	NM_026402; NM_001356366
	NP_001265641; NP_071933
	NP_080678; NP_001343295
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ATG3 (англ. Autophagy related 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 314 амінокислот, а молекулярна маса — 35 864^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQNVINTVKG	KALEVAEYLT	PVLKESKFKE	TGVITPEEFV	AAGDHLVHHC
PTWQWATGEE	LKVKAYLPTG	KQFLVTKNVP	CYKRCKQMEY	SDELEAIIEE
DDGDGGWVDT	YHNTGITGIT	EAVKEITLEN	KDNIRLQDCS	ALCEEEEDED
EGEAADMEEY	EESGLLETDE	ATLDTRKIVE	ACKAKTDAGG	EDAILQTRTY
DLYITYDKYY	QTPRLWLFGY	DEQRQPLTVE	HMYEDISQDH	VKKTVTIENH
PHLPPPPMCS	VHPCRHAEVM	KKIIETVAEG	GGELGVHMYL	LIFLKFVQAV
IPTIEYDYTR	HFTM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до лігаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p. J. Biol. Chem. 277: 13739—13744. PMID 11825910 DOI:10.1074/jbc.M200385200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tanida I., Nishitani T., Nemoto T., Ueno T., Kominami E. (2002). Mammalian Apg12p, but not the Apg12p.Apg5p conjugate, facilitates LC3 processing. Biochem. Biophys. Res. Commun. 296: 1164—1170. PMID 12207896 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02057-0
Tanida I., Sou Y.S., Minematsu-Ikeguchi N., Ueno T., Kominami E. (2006). Atg8L/Apg8L is the fourth mammalian modifier of mammalian Atg8 conjugation mediated by human Atg4B, Atg7 and Atg3. FEBS J. 273: 2553—2562. PMID 16704426 DOI:10.1111/j.1742-4658.2006.05260.x
Tanida I., Yamasaki M., Komatsu M., Ueno T. (2012). The FAP motif within human ATG7, an autophagy-related E1-like enzyme, is essential for the E2-substrate reaction of LC3 lipidation. Autophagy. 8: 88—97. PMID 22170151 DOI:10.4161/auto.8.1.18339