ATG4D

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
ATG4D
Ідентифікатори
Символи ATG4D, APG4-D, APG4D, AUTL4, autophagy related 4D cysteine peptidase, HsAPG4D
Зовнішні ІД OMIM: 611340 MGI: 2444308 HomoloGene: 13156 GeneCards: ATG4D
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001281504
NM_032885
NM_153583
RefSeq (білок)
NP_001268433
NP_116274
NP_705811
Локус (UCSC) Хр. 19: 10.54 – 10.55 Mb Хр. 9: 21.18 – 21.19 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ATG4D (англ. Autophagy related 4D cysteine peptidase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 474 амінокислот, а молекулярна маса — 52 922[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNSVSPAAAQYRSSSPEDARRRPEARRPRGPRGPDPNGLGPSGASGPALG
SPGAGPSEPDEVDKFKAKFLTAWNNVKYGWVVKSRTSFSKISSIHLCGRR
YRFEGEGDIQRFQRDFVSRLWLTYRRDFPPLPGGCLTSDCGWGCMLRSGQ
MMLAQGLLLHFLPRDWTWAEGMGLGPPELSGSASPSRYHGPARWMPPRWA
QGAPELEQERRHRQIVSWFADHPRAPFGLHRLVELGQSSGKKAGDWYGPS
LVAHILRKAVESCSDVTRLVVYVSQDCTVYKADVARLVARPDPTAEWKSV
VILVPVRLGGETLNPVYVPCVKELLRCELCLGIMGGKPRHSLYFIGYQDD
FLLYLDPHYCQPTVDVSQADFPLESFHCTSPRKMAFAKMDPSCTVGFYAG
DRKEFETLCSELTRVLSSSSATERYPMFTLAEGHAQDHSLDDLCSQLAQP
TLRLPRTGRLLRAKRPSSEDFVFL

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література[ред. | ред. код]

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Betin V.M., Lane J.D. (2009). Caspase cleavage of Atg4D stimulates GABARAP-L1 processing and triggers mitochondrial targeting and apoptosis.. J. Cell Sci. 122: 2554 — 2566.  PMID 19549685 DOI:10.1242/jcs.046250
  • Betin V.M., MacVicar T.D., Parsons S.F., Anstee D.J., Lane J.D. (2012). A cryptic mitochondrial targeting motif in Atg4D links caspase cleavage with mitochondrial import and oxidative stress.. Autophagy. 8: 664 — 676.  PMID 22441018 DOI:10.4161/auto.19227

Примітки[ред. | ред. код]

  1. Human PubMed Reference:. 
  2. Mouse PubMed Reference:. 
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20789 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017. 
  4. UniProt, Q86TL0 (англ.). Архів оригіналу за 28 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. 

Див. також[ред. | ред. код]