BOC

BOC
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3N1G, 3N1M, 3N1P
Ідентифікатори
Символи	BOC, CDON2, BOC cell adhesion associated, oncogene regulated, Boi
Зовнішні ІД	OMIM: 608708 MGI: 2151153 HomoloGene: 32819 GeneCards: BOC
Пов'язані генетичні захворювання
карієс зубів
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • axonal growth cone • integral component of plasma membrane • мембрана • нуклеоплазма Біологічний процес • smoothened signaling pathway • адгезія клітин • positive regulation of myoblast differentiation • positive regulation of muscle cell differentiation • axon guidance Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	91653	117606
Ensembl	ENSG00000144857	ENSMUSG00000022687
UniProt	Q9BWV1	Q6AZB0
RefSeq (мРНК)	NM_001301861 NM_001301867 NM_033254 NM_001378073 NM_001378074 NM_001378075 NM_001387919 NM_001387920 NM_001387921 NM_001387922 NM_001387923 NM_001387924 NM_001387925 NM_001387926 NM_001387927 NM_001387928 NM_001387929 NM_001387930 NM_001387932	NM_172506
RefSeq (білок)	NP_001288790 NP_001288796 NP_150279 NP_001365002 NP_001365003 NP_001365004	NP_766094
Локус (UCSC)	Хр. 3: 113.21 – 113.29 Mb	Хр. 16: 44.31 – 44.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BOC (англ. BOC cell adhesion associated, oncogene regulated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 114 амінокислот, а молекулярна маса — 121 059.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLRGTMTAWR		GMRPEVTLAC		LLLATAGCFA		DLNEVPQVTV		QPASTVQKPG
GTVILGCVVE		PPRMNVTWRL		NGKELNGSDD		ALGVLITHGT		LVITALNNHT
VGRYQCVARM		PAGAVASVPA		TVTLANLQDF		KLDVQHVIEV		DEGNTAVIAC
HLPESHPKAQ		VRYSVKQEWL		EASRGNYLIM		PSGNLQIVNA		SQEDEGMYKC
AAYNPVTQEV		KTSGSSDRLR		VRRSTAEAAR		IIYPPEAQTI		IVTKGQSLIL
ECVASGIPPP		RVTWAKDGSS		VTGYNKTRFL		LSNLLIDTTS		EEDSGTYRCM
ADNGVGQPGA		AVILYNVQVF		EPPEVTMELS		QLVIPWGQSA		KLTCEVRGNP
PPSVLWLRNA		VPLISSQRLR		LSRRALRVLS		MGPEDEGVYQ		CMAENEVGSA
HAVVQLRTSR		PSITPRLWQD		AELATGTPPV		SPSKLGNPEQ		MLRGQPALPR
PPTSVGPASP		QCPGEKGQGA		PAEAPIILSS		PRTSKTDSYE		LVWRPRHEGS
GRAPILYYVV		KHRKVTNSSD		DWTISGIPAN		QHRLTLTRLD		PGSLYEVEMA
AYNCAGEGQT		AMVTFRTGRR		PKPEIMASKE		QQIQRDDPGA		SPQSSSQPDH
GRLSPPEAPD		RPTISTASET		SVYVTWIPRG		NGGFPIQSFR		VEYKKLKKVG
DWILATSAIP		PSRLSVEITG		LEKGTSYKFR		VRALNMLGES		EPSAPSRPYV
VSGYSGRVYE		RPVAGPYITF		TDAVNETTIM		LKWMYIPASN		NNTPIHGFYI
YYRPTDSDND		SDYKKDMVEG		DKYWHSISHL		QPETSYDIKM		QCFNEGGESE
FSNVMICETK		ARKSSGQPGR		LPPPTLAPPQ		PPLPETIERP		VGTGAMVARS
SDLPYLIVGV		VLGSIVLIIV		TFIPFCLWRA		WSKQKHTTDL		GFPRSALPPS
CPYTMVPLGG		LPGHQASGQP		YLSGISGRAC		ANGIHMNRGC		PSAAVGYPGM
KPQQHCPGEL		QQQSDTSSLL		RQTHLGNGYD		PQSHQITRGP		KSSPDEGSFL
YTLPDDSTHQ		LLQPHHDCCQ		RQEQPAAVGQ		SGVRRAPDSP		VLEAVWDPPF
HSGPPCCLGL		VPVEEVDSPD		SCQVSGGDWC		PQHPVGAYVG		QEPGMQLSPG
PLVRVSFETP		PLTI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Kang J.-S., Mulieri P.J., Hu Y., Taliana L., Krauss R.S. (2002). BOC, an Ig superfamily member, associates with CDO to positively regulate myogenic differentiation. EMBO J. 21: 114—124. PMID 11782431 DOI:10.1093/emboj/21.1.114
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Kang J.-S., Feinleib J.L., Knox S., Ketteringham M.A., Krauss R.S. (2003). Promyogenic members of the Ig and cadherin families associate to positively regulate differentiation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 3989—3994. PMID 12634428 DOI:10.1073/pnas.0736565100
• Kavran J.M., Ward M.D., Oladosu O.O., Mulepati S., Leahy D.J. (2010). All mammalian Hedgehog proteins interact with cell adhesion molecule, down-regulated by oncogenes (CDO) and brother of CDO (BOC) in a conserved manner. J. Biol. Chem. 285: 24584—24590. PMID 20519495 DOI:10.1074/jbc.M110.131680

Див. також

• Хромосома 3