BORCS5

BORCS5
Ідентифікатори
Символи	BORCS5, LOH1CR12, LOH12CR1, BLOC-1 related complex subunit 5
Зовнішні ІД	OMIM: 616598 MGI: 1915024 HomoloGene: 12188 GeneCards: BORCS5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • мембрана • cytoplasmic side of lysosomal membrane • intrinsic component of membrane • plus-end kinesin complex • лізосома • lysosomal membrane • BORC complex Біологічний процес • organelle transport along microtubule • lysosome localization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	118426	67774
Ensembl	ENSG00000280689 ENSG00000165714	ENSMUSG00000042992
UniProt	Q969J3	Q9D920
RefSeq (мРНК)	NM_001300742 NM_058169 NM_001330356	NM_001170479 NM_026371
RefSeq (білок)	NP_001287671 NP_001317285 NP_477517	NP_001163950 NP_080647
Локус (UCSC)	Хр. 12: 12.36 – 12.47 Mb	Хр. 6: 134.62 – 134.69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BORCS5 (англ. BLOC-1 related complex subunit 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 196 амінокислот, а молекулярна маса — 22 222.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSEQSSEAE		SRPNDLNSSV		TPSPAKHRAK		MDDIVVVAQG		SQASRNVSND
PDVIKLQEIP		TFQPLLKGLL		SGQTSPTNAK		LEKLDSQQVL		QLCLRYQDHL
HQCAEAVAFD		QNALVKRIKE		MDLSVETLFS		FMQERQKRYA		KYAEQIQKVN
EMSAILRRIQ		MGIDQTVPLL		DRLNSMLPEG		ERLEPFSMKP		DRELRL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до фосфопротеїнів, ліпопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, лізосомі.

Література

• Montpetit A., Boily G., Sinnett D. (2002). A detailed transcriptional map of the chromosome 12p12 tumour suppressor locus. Eur. J. Hum. Genet. 10: 62—71. PMID 11896457 DOI:10.1038/sj.ejhg.5200766
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 12