C1QTNF5

C1QTNF5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4F3J, 4NN0
Ідентифікатори
Символи	C1QTNF5, CTRP5, C1q and tumor necrosis factor related protein 5, C1q and TNF related 5, MFRP
Зовнішні ІД	OMIM: 608752 MGI: 2385958 HomoloGene: 9227 GeneCards: C1QTNF5
Пов'язані генетичні захворювання
late-onset retinal degenration
Онтологія гена Молекулярна функція • identical protein binding Клітинна компонента • extracellular region • Колаген • cell projection • мембрана • lateral plasma membrane • apical plasma membrane • клітинна мембрана • transport vesicle • bicellular tight junction • міжклітинний простір Біологічний процес • protein secretion • protein trimerization • inner ear development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	114902	235312
Ensembl	ENSG00000223953	ENSMUSG00000079592
UniProt	Q9BXJ0	Q8K480 Q8K479
RefSeq (мРНК)	NM_015645 NM_001278431	NM_001040631 NM_001040632 NM_001190313 NM_001190319 NM_145613
RefSeq (білок)	NP_001265360 NP_056460	NP_001177243 NP_667337 NP_001035721 NP_001035722 NP_001177242 NP_001177248 NP_663588
Локус (UCSC)	Хр. 11: 119.34 – 119.34 Mb	Хр. 9: 44.02 – 44.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

C1QTNF5 (англ. C1q and TNF related 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 243 амінокислот, а молекулярна маса — 25 298.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRPLLVLLLL		GLAAGSPPLD		DNKIPSLCPG		HPGLPGTPGH		HGSQGLPGRD
GRDGRDGAPG		APGEKGEGGR		PGLPGPRGDP		GPRGEAGPAG		PTGPAGECSV
PPRSAFSAKR		SESRVPPPSD		APLPFDRVLV		NEQGHYDAVT		GKFTCQVPGV
YYFAVHATVY		RASLQFDLVK		NGESIASFFQ		FFGGWPKPAS		LSGGAMVRLE
PEDQVWVQVG		VGDYIGIYAS		IKTDSTFSGF		LVYSDWHSSP		VFA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Tu X., Palczewski K. (2012). Crystal structure of the globular domain of C1QTNF5: Implications for late-onset retinal macular degeneration. J. Struct. Biol. 180: 439—446. PMID 22892318 DOI:10.1016/j.jsb.2012.07.011

Див. також

• Хромосома 11