C20orf196

C20orf196
Ідентифікатори
Символи	SHLD1, chromosome 20 open reading frame 196, shieldin complex subunit 1, RINN3, C20orf196
Зовнішні ІД	OMIM: 618028 MGI: 1920997 HomoloGene: 51865 GeneCards: SHLD1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • хромосома • site of double-strand break Біологічний процес • positive regulation of isotype switching • negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination • positive regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	149840	73747
Ensembl	ENSG00000171984	ENSMUSG00000044991
UniProt	Q8IYI0	Q9D112
RefSeq (мРНК)	NM_001303477 NM_001303478 NM_001303479 NM_152504	NM_028637 NM_001358260 NM_001358261
RefSeq (білок)	NP_001290406 NP_001290407 NP_001290408 NP_689717	NP_082913 NP_001345189 NP_001345190
Локус (UCSC)	Хр. 20: 5.75 – 5.86 Mb	Хр. 2: 132.53 – 132.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

C20orf196 (англ. Chromosome 20 open reading frame 196) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 205 амінокислот, а молекулярна маса — 22 938.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAARDATSGS		LSEESSALDL		PSACDIRDYV		LQGPSQEANS		EAFSSLEFHS
FPYSSDVDPD		TSNLNIEQNN		SWTAENFWLD		PAVKGQSEKE		EDDGLRKSLD
RFYEMFGHPQ		PGSANSLSAS		VCKCLSQKIT		QLRGQESQKY		ALRSFQMARV
IFNRDGCSVL		QRHSRDTHFY		PLEEGSTSLD		DEKPNPGLSK		DITHFLLQQN
VMKDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20