CAPN13

CAPN13
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2I7A
Ідентифікатори
Символи	CAPN13, calpain 13
Зовнішні ІД	OMIM: 610228 MGI: 2685789 HomoloGene: 27026 GeneCards: CAPN13
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • цитоплазма Біологічний процес • протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	92291	381122
Ensembl	ENSG00000162949	ENSMUSG00000043705
UniProt	Q6MZZ7	Q3UW68
RefSeq (мРНК)	NM_144575	NM_001033444
RefSeq (білок)	NP_653176	NP_001028616
Локус (UCSC)	Хр. 2: 30.72 – 30.82 Mb	Хр. 17: 73.61 – 73.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CAPN13 (англ. Calpain 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 669 амінокислот, а молекулярна маса — 76 696.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAYYQEPSVE		TSIIKFKDQD		FTTLRDHCLS		MGRTFKDETF		PAADSSIGQK
LLQEKRLSNV		IWKRPQDLPG		GPPHFILDDI		SRFDIQQGGA		ADCWFLAALG
SLTQNPQYRQ		KILMVQSFSH		QYAGIFRFRF		WQCGQWVEVV		IDDRLPVQGD
KCLFVRPRHQ		NQEFWPCLLE		KAYAKLLGSY		SDLHYGFLED		ALVDLTGGVI
TNIHLHSSPV		DLVKAVKTAT		KAGSLITCAT		PSGPTDTAQA		MENGLVSLHA
YTVTGAEQIQ		YRRGWEEIIS		LWNPWGWGEA		EWRGRWSDGS		QEWEETCDPR
KSQLHKKRED		GEFWMSCQDF		QQKFIAMFIC		SEIPITLDHG		NTLHEGWSQI
MFRKQVILGN		TAGGPRNDAQ		FNFSVQEPME		GTNVVVCVTV		AVTPSNLKAE
DAKFPLDFQV		ILAGSQRFRE		KFPPVFFSSF		RNTVQSSNNK		FRRNFTMTYH
LSPGNYVVVA		QTRRKSAEFL		LRIFLKMPDS		DRHLSSHFNL		RMKGSPSEHG
SQQSIFNRYA		QQRLDIDATQ		LQGLLNQELL		TGPPGDMFSL		DECRSLVALM
ELKVNGRLDQ		EEFARLWKRL		VHYQHVFQKV		QTSPGVLLSS		DLWKAIENTD
FLRGIFISRE		LLHLVTLRYS		DSVGRVSFPS		LVCFLMRLEA		MAKTFRNLSK
DGKGLYLTEM		EWMSLVMYN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Dear T.N., Boehm T. (2001). Identification and characterization of two novel calpain large subunit genes. Gene. 274: 245—252. PMID 11675017 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00599-6

Див. також

• Хромосома 2