CAPN2

CAPN2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1KFU, 1KFX, 2NQA
Ідентифікатори
Символи	CAPN2, CANP2, CANPL2, CANPml, mCANP, calpain 2
Зовнішні ІД	OMIM: 114230 MGI: 88264 HomoloGene: 1326 GeneCards: CAPN2
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • cysteine-type peptidase activity • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • hydrolase activity • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity • enzyme binding Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • Псевдоподія • мембрана • focal adhesion • perinuclear endoplasmic reticulum • внутрішньоклітинний • дендрит (нейробіологія) • ендоплазматичний ретикулум • cortical actin cytoskeleton • membrane raft • Хроматин • лізосома • екзосома • клітинне ядро • гіалоплазма • цитоплазма • клітинна мембрана • мітохондріальний міжмембранний простір • external side of plasma membrane • cell projection • neuronal cell body Біологічний процес • response to hypoxia • protein autoprocessing • протеоліз • cellular response to amino acid stimulus • myoblast fusion • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • regulation of cytoskeleton organization • blastocyst development • extracellular matrix disassembly • жіноча вагітність • positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process • regulation of interleukin-6 production • cellular response to interferon-beta • response to hydrogen peroxide • behavioral response to pain • cellular response to lipopolysaccharide • positive regulation of neuron death • positive regulation of myoblast fusion • positive regulation of phosphatidylcholine biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	824	12334
Ensembl	ENSG00000162909	ENSMUSG00000026509
UniProt	P17655	O08529
RefSeq (мРНК)	NM_001146068 NM_001748	NM_009794
RefSeq (білок)	NP_001139540 NP_001739	NP_033924
Локус (UCSC)	Хр. 1: 223.7 – 223.78 Mb	Хр. 1: 182.29 – 182.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CAPN2 (англ. Calpain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 700 амінокислот, а молекулярна маса — 79 995.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGIAAKLAK		DREAAEGLGS		HDRAIKYLNQ		DYEALRNECL		EAGTLFQDPS
FPAIPSALGF		KELGPYSSKT		RGIEWKRPTE		ICADPQFIIG		GATRTDICQG
ALGDCWLLAA		IASLTLNEEI		LARVVPLNQS		FQENYAGIFH		FQFWQYGEWV
EVVVDDRLPT		KDGELLFVHS		AEGSEFWSAL		LEKAYAKING		CYEALSGGAT
TEGFEDFTGG		IAEWYELKKP		PPNLFKIIQK		ALQKGSLLGC		SIDITSAADS
EAITFQKLVK		GHAYSVTGAE		EVESNGSLQK		LIRIRNPWGE		VEWTGRWNDN
CPSWNTIDPE		ERERLTRRHE		DGEFWMSFSD		FLRHYSRLEI		CNLTPDTLTS
DTYKKWKLTK		MDGNWRRGST		AGGCRNYPNT		FWMNPQYLIK		LEEEDEDEED
GESGCTFLVG		LIQKHRRRQR		KMGEDMHTIG		FGIYEVPEEL		SGQTNIHLSK
NFFLTNRARE		RSDTFINLRE		VLNRFKLPPG		EYILVPSTFE		PNKDGDFCIR
VFSEKKADYQ		AVDDEIEANL		EEFDISEDDI		DDGFRRLFAQ		LAGEDAEISA
FELQTILRRV		LAKRQDIKSD		GFSIETCKIM		VDMLDSDGSG		KLGLKEFYIL
WTKIQKYQKI		YREIDVDRSG		TMNSYEMRKA		LEEAGFKMPC		QLHQVIVARF
ADDQLIIDFD		NFVRCLVRLE		TLFKIFKQLD		PENTGTIELD		LISWLCFSVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• Ye Z., Connor J.R. (2000). cDNA cloning by amplification of circularized first strand cDNAs reveals non-IRE-regulated iron-responsive mRNAs. Biochem. Biophys. Res. Commun. 275: 223—227. PMID 10944468 DOI:10.1006/bbrc.2000.3282
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sanchez-Sanchez F., Martinez-Redondo F., Aroca-Aguilar J.D., Coca-Prados M., Escribano J. (2007). Characterization of the intracellular proteolytic cleavage of myocilin and identification of calpain II as a myocilin-processing protease. J. Biol. Chem. 282: 27810—27824. PMID 17650508 DOI:10.1074/jbc.M609608200
• Hata A., Ohno S., Akita Y., Suzuki K. (1989). Tandemly reiterated negative enhancer-like elements regulate transcription of a human gene for the large subunit of calcium-dependent protease. J. Biol. Chem. 264: 6404—6411. PMID 2539381

Див. також

• Хромосома 1