CCDC47

CCDC47
Ідентифікатори
Символи	CCDC47, MSTP041, GK001, coiled-coil domain containing 47, THNS
Зовнішні ІД	OMIM: 618260 MGI: 1914413 HomoloGene: 41351 GeneCards: CCDC47
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • integral component of membrane • rough endoplasmic reticulum • мембрана • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • post-embryonic development • calcium ion homeostasis • osteoblast differentiation • endoplasmic reticulum organization • ubiquitin-dependent ERAD pathway • ER overload response Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57003	67163
Ensembl	ENSG00000108588	ENSMUSG00000078622
UniProt	Q96A33	Q9D024
RefSeq (мРНК)	NM_020198	NM_026009
RefSeq (білок)	NP_064583	NP_080285
Локус (UCSC)	Хр. 17: 63.75 – 63.78 Mb	Хр. 11: 106.09 – 106.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CCDC47 (англ. Coiled-coil domain containing 47) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 483 амінокислот, а молекулярна маса — 55 874.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKAFHTFCVV		LLVFGSVSEA		KFDDFEDEED		IVEYDDNDFA		EFEDVMEDSV
TESPQRVIIT		EDDEDETTVE		LEGQDENQEG		DFEDADTQEG		DTESEPYDDE
EFEGYEDKPD		TSSSKNKDPI		TIVDVPAHLQ		NSWESYYLEI		LMVTGLLAYI
MNYIIGKNKN		SRLAQAWFNT		HRELLESNFT		LVGDDGTNKE		ATSTGKLNQE
NEHIYNLWCS		GRVCCEGMLI		QLRFLKRQDL		LNVLARMMRP		VSDQVQIKVT
MNDEDMDTYV		FAVGTRKALV		RLQKEMQDLS		EFCSDKPKSG		AKYGLPDSLA
ILSEMGEVTD		GMMDTKMVHF		LTHYADKIES		VHFSDQFSGP		KIMQEEGQPL
KLPDTKRTLL		FTFNVPGSGN		TYPKDMEALL		PLMNMVIYSI		DKAKKFRLNR
EGKQKADKNR		ARVEENFLKL		THVQRQEAAQ		SRREEKKRAE		KERIMNEEDP
EKQRRLEEAA		LRREQKKLEK		KQMKMKQIKV		KAM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17