CCDC6

CCDC6
Ідентифікатори
Символи	CCDC6, D10S170, H4, PTC, TPC, TST1, coiled-coil domain containing 6
Зовнішні ІД	OMIM: 601985 MGI: 1923801 HomoloGene: 34786 GeneCards: CCDC6
Онтологія гена Молекулярна функція • SH3 domain binding • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • Цитоскелет • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • cytoskeleton organization • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8030	76551
Ensembl	ENSG00000108091	ENSMUSG00000048701
UniProt	Q16204	D3YZP9
RefSeq (мРНК)	NM_005436	NM_001111121
RefSeq (білок)	NP_005427	NP_001104591
Локус (UCSC)	Хр. 10: 59.79 – 59.91 Mb	Хр. 10: 69.93 – 70.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CCDC6 (англ. Coiled-coil domain containing 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 474 амінокислот, а молекулярна маса — 53 291.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADSASESDT		DGAGGNSSSS		AAMQSSCSST		SGGGGGGGGG		GGGGKSGGIV
ISPFRLEELT		NRLASLQQEN		KVLKIELETY		KLKCKALQEE		NRDLRKASVT
IQARAEQEEE		FISNTLFKKI		QALQKEKETL		AVNYEKEEEF		LTNELSRKLM
QLQHEKAELE		QHLEQEQEFQ		VNKLMKKIKK		LENDTISKQL		TLEQLRREKI
DLENTLEQEQ		EALVNRLWKR		MDKLEAEKRI		LQEKLDQPVS		APPSPRDISM
EIDSPENMMR		HIRFLKNEVE		RLKKQLRAAQ		LQHSEKMAQY		LEEERHMREE
NLRLQRKLQR		EMERREALCR		QLSESESSLE		MDDERYFNEM		SAQGLRPRTV
SSPIPYTPSP		SSSRPISPGL		SYASHTVGFT		PPTSLTRAGM		SYYNSPGLHV
QHMGTSHGIT		RPSPRRSNSP		DKFKRPTPPP		SPNTQTPVQP		PPPPPPPPMQ
PTVPSAATSQ		PTPSQHSAHP		SSQP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 10