CD163L1

CD163L1
Ідентифікатори
Символи	CD163L1, CD163B, M160, SCARI2, CD163 molecule like 1, WC1, STAR
Зовнішні ІД	OMIM: 606079 HomoloGene: 138426 GeneCards: CD163L1
Онтологія гена Молекулярна функція • scavenger receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • extracellular region • клітинна мембрана • мембрана • external side of plasma membrane Біологічний процес • рецептор-опосередкований ендоцитоз • vesicle-mediated transport • ендоцитоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	283316	н/д
Ensembl	ENSG00000177675	н/д
UniProt	Q9NR16	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001297650 NM_174941	н/д
RefSeq (білок)	NP_001284579 NP_777601	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 12: 7.35 – 7.48 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

CD163L1 (англ. CD163 molecule like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 453 амінокислот, а молекулярна маса — 159 239.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMLPQNSWHI		DFGRCCCHQN		LFSAVVTCIL		LLNSCFLISS		FNGTDLELRL
VNGDGPCSGT		VEVKFQGQWG		TVCDDGWNTT		ASTVVCKQLG		CPFSFAMFRF
GQAVTRHGKI		WLDDVSCYGN		ESALWECQHR		EWGSHNCYHG		EDVGVNCYGE
ANLGLRLVDG		NNSCSGRVEV		KFQERWGTIC		DDGWNLNTAA		VVCRQLGCPS
SFISSGVVNS		PAVLRPIWLD		DILCQGNELA		LWNCRHRGWG		NHDCSHNEDV
TLTCYDSSDL		ELRLVGGTNR		CMGRVELKIQ		GRWGTVCHHK		WNNAAADVVC
KQLGCGTALH		FAGLPHLQSG		SDVVWLDGVS		CSGNESFLWD		CRHSGTVNFD
CLHQNDVSVI		CSDGADLELR		LADGSNNCSG		RVEVRIHEQW		WTICDQNWKN
EQALVVCKQL		GCPFSVFGSR		RAKPSNEARD		IWINSISCTG		NESALWDCTY
DGKAKRTCFR		RSDAGVICSD		KADLDLRLVG		AHSPCYGRLE		VKYQGEWGTV
CHDRWSTRNA		AVVCKQLGCG		KPLHVFGMTY		FKEASGPIWL		DDVSCIGNES
NIWDCEHSGW		GKHNCVHRED		VIVTCSGDAT		WGLRLVGGSN		RCSGRLEVYF
QGRWGTVCDD		GWNSKAAAVV		CSQLDCPSSI		IGMGLGNAST		GYGKIWLDDV
SCDGDESDLW		SCRNSGWGNN		DCSHSEDVGV		ICSDASDMEL		RLVGGSSRCA
GKVEVNVQGA		VGILCANGWG		MNIAEVVCRQ		LECGSAIRVS		REPHFTERTL
HILMSNSGCT		GGEASLWDCI		RWEWKQTACH		LNMEASLICS		AHRQPRLVGA
DMPCSGRVEV		KHADTWRSVC		DSDFSLHAAN		VLCRELNCGD		AISLSVGDHF
GKGNGLTWAE		KFQCEGSETH		LALCPIVQHP		EDTCIHSREV		GVVCSRYTDV
RLVNGKSQCD		GQVEINVLGH		WGSLCDTHWD		PEDARVLCRQ		LSCGTALSTT
GGKYIGERSV		RVWGHRFHCL		GNESLLDNCQ		MTVLGAPPCI		HGNTVSVICT
GSLTQPLFPC		LANVSDPYLS		AVPEGSALIC		LEDKRLRLVD		GDSRCAGRVE
IYHDGFWGTI		CDDGWDLSDA		HVVCQKLGCG		VAFNATVSAH		FGEGSGPIWL
DDLNCTGMES		HLWQCPSRGW		GQHDCRHKED		AGVICSEFTA		LRLYSETETE
SCAGRLEVFY		NGTWGSVGRR		NITTAIAGIV		CRQLGCGENG		VVSLAPLSKT
GSGFMWVDDI		QCPKTHISIW		QCLSAPWERR		ISSPAEETWI		TCEDRIRVRG
GDTECSGRVE		IWHAGSWGTV		CDDSWDLAEA		EVVCQQLGCG		SALAALRDAS
FGQGTGTIWL		DDMRCKGNES		FLWDCHAKPW		GQSDCGHKED		AGVRCSGQSL
KSLNASSGHL		ALILSSIFGL		LLLVLFILFL		TWCRVQKQKH		LPLRVSTRRR
GSLEENLFHE		METCLKREDP		HGTRTSDDTP		NHGCEDASDT		SLLGVLPASE
ATK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Groenlund J., Vitved L., Lausen M., Skjoedt K., Holmskov U. (2000). Cloning of a novel scavenger receptor cysteine-rich type I transmembrane molecule (M160) expressed by human macrophages. J. Immunol. 165: 6406—6415. PMID 11086079 DOI:10.4049/jimmunol.165.11.6406
• Van Gorp H., Van Breedam W., Van Doorsselaere J., Delputte P.L., Nauwynck H.J. (2010). Identification of the CD163 protein domains involved in infection of the porcine reproductive and respiratory syndrome virus. J. Virol. 84: 3101—3105. PMID 20032174 DOI:10.1128/JVI.02093-09
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Див. також

• Хромосома 12