CDC42EP1

CDC42EP1
Ідентифікатори
Символи	CDC42EP1, BORG5, CEP1, MSE55, CDC42 effector protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606084 MGI: 1929763 HomoloGene: 5128 GeneCards: CDC42EP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • cadherin binding involved in cell-cell adhesion Клітинна компонента • цитоскелет • мембрана • система ендомембран • focal adhesion • цитоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • positive regulation of pseudopodium assembly • positive regulation of actin filament polymerization • Rho protein signal transduction • regulation of cell shape • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11135	104445
Ensembl	ENSG00000128283	ENSMUSG00000049521
UniProt	Q00587	Q91W92
RefSeq (мРНК)	NM_152243	NM_027219
RefSeq (білок)	NP_689449	NP_081495
Локус (UCSC)	Хр. 22: 37.56 – 37.57 Mb	Хр. 15: 78.73 – 78.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDC42EP1 (англ. CDC42 effector protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислот, а молекулярна маса — 40 295.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPGPQGGRGA		ATMSLGKLSP		VGWVSSSQGK		RRLTADMISH		PLGDFRHTMH
VGRGGDVFGD		TSFLSNHGGS		SGSTHRSPRS		FLAKKLQLVR		RVGAPPRRMA
SPPAPSPAPP		AISPIIKNAI		SLPQLNQAAY		DSLVVGKLSF		DSSPTSSTDG
HSSYGLDSGF		CTISRLPRSE		KPHDRDRDGS		FPSEPGLRRS		DSLLSFRLDL
DLGPSLLSEL		LGVMSLPEAP		AAETPAPAAN		PPAPTANPTG		PAANPPATTA
NPPAPAANPS		APAATPTGPA		ANPPAPAASS		TPHGHCPNGV		TAGLGPVAEV
KSSPVGGGPR		GPAGPALGRH		WGAGWDGGHH		YPEMDARQER		VEVLPQARAS
WESLDEEWRA		PQAGSRTPVP		STVQANTFEF		ADAEEDDEVK		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Joberty G., Perlungher R.R., Macara I.G. (1999). The Borgs, a new family of Cdc42 and TC10 GTPase-interacting proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 6585—6597. PMID 10490598 DOI:10.1128/MCB.19.10.6585
• Burbelo P.D., Snow D.M., Bahou W., Spiegel S. (1999). MSE55, a Cdc42 effector protein, induces long cellular extensions in fibroblasts. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 9083—9088. PMID 10430899 DOI:10.1073/pnas.96.16.9083
• Bahou W.F., Campbell A.D., Wicha M.S. (1992). cDNA cloning and molecular characterization of MSE55, a novel human serum constituent protein that displays bone marrow stromal/endothelial cell-specific expression. J. Biol. Chem. 267: 13986—13992. PMID 1629197

Див. також

• Хромосома 22