CDH10

CDH10
Ідентифікатори
Символи	CDH10, cadherin 10
Зовнішні ІД	OMIM: 604555 MGI: 107436 HomoloGene: 68530 GeneCards: CDH10
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of presynaptic active zone membrane • integral component of postsynaptic specialization membrane • cell surface • catenin complex Біологічний процес • адгезія клітин • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell adhesion • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1008	320873
Ensembl	ENSG00000040731	ENSMUSG00000022321
UniProt	Q9Y6N8	P70408
RefSeq (мРНК)	NM_001190450 NM_006727 NM_001317222 NM_001317224 NM_001362460	NM_009865 NM_001316758
RefSeq (білок)	NP_001304151 NP_001304153 NP_006718 NP_001349389 NP_001304153.1	NP_001303687 NP_033995
Локус (UCSC)	Хр. 5: 24.49 – 24.64 Mb	Хр. 15: 18.82 – 19.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH10 (англ. Cadherin 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 788 амінокислот, а молекулярна маса — 88 451.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTIHQFLLLF		LFWVCLPHFC		SPEIMFRRTP		VPQQRILSSR		VPRSDGKILH
RQKRGWMWNQ		FFLLEEYTGS		DYQYVGKLHS		DQDKGDGSLK		YILSGDGAGT
LFIIDEKTGD		IHATRRIDRE		EKAFYTLRAQ		AINRRTLRPV		EPESEFVIKI
HDINDNEPTF		PEEIYTASVP		EMSVVGTSVV		QVTATDADDP		SYGNSARVIY
SILQGQPYFS		VEPETGIIRT		ALPNMNRENR		EQYQVVIQAK		DMGGQMGGLS
GTTTVNITLT		DVNDNPPRFP		QNTIHLRVLE		SSPVGTAIGS		VKATDADTGK
NAEVEYRIID		GDGTDMFDIV		TEKDTQEGII		TVKKPLDYES		RRLYTLKVEA
ENTHVDPRFY		YLGPFKDTTI		VKISIEDVDE		PPVFSRSSYL		FEVHEDIEVG
TIIGTVMARD		PDSISSPIRF		SLDRHTDLDR		IFNIHSGNGS		LYTSKPLDRE
LSQWHNLTVI		AAEINNPKET		TRVAVFVRIL		DVNDNAPQFA		VFYDTFVCEN
ARPGQLIQTI		SAVDKDDPLG		GQKFFFSLAA		VNPNFTVQDN		EDNTARILTR
KNGFNRHEIS		TYLLPVVISD		NDYPIQSSTG		TLTIRVCACD		SQGNMQSCSA
EALLLPAGLS		TGALIAILLC		IIILLVIVVL		FAALKRQRKK		EPLILSKEDI
RDNIVSYNDE		GGGEEDTQAF		DIGTLRNPAA		IEEKKLRRDI		IPETLFIPRR
TPTAPDNTDV		RDFINERLKE		HDLDPTAPPY		DSLATYAYEG		NDSIAESLSS
LESGTTEGDQ		NYDYLREWGP		RFNKLAEMYG		GGESDKDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Kools P., Vanhalst K., van den Eynde E., van Roy F. (1999). The human cadherin-10 gene: complete coding sequence, predominant expression in the brain, and mapping on chromosome 5p13-14. FEBS Lett. 452: 328—334. PMID 10386616 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00672-9
• Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins. Biochem. J. 349: 159—167. PMID 10861224 DOI:10.1042/0264-6021:3490159

Див. також

• Хромосома 5