CDH20

CDH20
Ідентифікатори
Символи	CDH20, CDH7L3, Cdh7, cadherin 20
Зовнішні ІД	OMIM: 605807 MGI: 1346069 HomoloGene: 8015 GeneCards: CDH20
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • cell surface • catenin complex Біологічний процес • адгезія клітин • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • adherens junction organization • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	28316	23836
Ensembl	ENSG00000101542	ENSMUSG00000050840
UniProt	Q9HBT6	Q9Z0M3
RefSeq (мРНК)	NM_031891	NM_011800
RefSeq (білок)	NP_114097	NP_035930
Локус (UCSC)	Хр. 18: 61.33 – 61.56 Mb	Хр. 1: 104.7 – 104.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH20 (англ. Cadherin 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 801 амінокислот, а молекулярна маса — 88 993.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWTSGRMSNA		KNWLGLGMSL		YFWGLMDLTT		TVLSDTPTPQ		GELEALLSDK
PQSHQRTKRS		WVWNQFFVLE		EYTGTDPLYV		GKLHSDMDRG		DGSIKYILSG
EGAGIVFTID		DTTGDIHAIQ		RLDREERAQY		TLRAQALDRR		TGRPMEPESE
FIIKIQDIND		NEPKFLDGPY		VATVPEMSPV		GTSVIQVTAT		DADDPTYGNS
ARVVYSILQG		QPYFSVDSKT		GVIRTALMNM		DREAKEYYEV		IIQAKDMGGQ
LGGLAGTTTV		NITLSDVNDN		PPRFPQKHYQ		MSVLESAPIS		STVGRVFAKD
LDEGINAEMK		YTIVDGDGAD		AFDISTDPNF		QVGIITVKKP		LSFESKKSYT
LKVEGANPHL		EMRFLNLGPF		QDTTTVHISV		EDVDEPPVFE		PGFYFVEVPE
DVAIGTTIQI		ISAKDPDVTN		NSIRYSIDRS		SDPGRFFYVD		ITTGALMTAR
PLDREEFSWH		NITVLAMEMN		NPSQVGSVPV		TIKVLDVNDN		APEFPRFYEA
FVCENAKAGQ		LIQTVSAVDQ		DDPRNGQHFY		YSLAPEAANN		PNFTIRDNQD
NTARILTRRS		GFRQQEQSVF		HLPILIADSG		QPVLSSTGTL		TIQVCSCDDD
GHVMSCSPEA		YMLPVSLSRG		ALIAILACIF		VLLVLVLLIL		SMRRHRKQPY
IIDDEENIHE		NIVRYDDEGG		GEEDTEAFDI		AAMWNPREAQ		AGAAPKTRQD
MLPEIESLSR		YVPQTCAVNS		TVHSYVLAKL		YEADMDLWAP		PFDSLQTYMF
EGDGSVAGSL		SSLQSATSDS		EQSFDFLTDW		GPRFRKLAEL		YGASEGPAPL
W

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Kools P., Van Imschoot G., van Roy F. (2000). Characterization of three novel human cadherin genes (CDH7, CDH19, and CDH20) clustered on chromosome 18q22-q23 and with high homology to chicken cadherin-7. Genomics. 68: 283—295. PMID 10995570 DOI:10.1006/geno.2000.6305
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 18