CDH8

CDH8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ZXK, 2A62
Ідентифікатори
Символи	CDH8, Nbla04261, cadherin 8
Зовнішні ІД	OMIM: 603008 MGI: 107434 HomoloGene: 55604 GeneCards: CDH8
Пов'язані генетичні захворювання
недрібноклітинна карцинома легенів
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • axon terminus • integral component of membrane • synaptic cleft • мембрана • клітинна мембрана • synaptic membrane • glutamatergic synapse • cell surface • catenin complex Біологічний процес • response to cold • адгезія клітин • adherens junction organization • synaptic transmission, glutamatergic • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • chemical synaptic transmission • GO:1904739 regulation of synapse organization • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1006	12564
Ensembl	ENSG00000150394	ENSMUSG00000036510
UniProt	P55286	P97291
RefSeq (мРНК)	NM_001796	NM_001039154 NM_001285913 NM_001285914 NM_007667
RefSeq (білок)	NP_001787	NP_001034243 NP_001272842 NP_001272843 NP_031693
Локус (UCSC)	Хр. 16: 61.65 – 62.04 Mb	Хр. 8: 99.75 – 100.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH8 (англ. Cadherin 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 799 амінокислот, а молекулярна маса — 88 253.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPERLAEMLL		DLWTPLIILW		ITLPPCIYMA		PMNQSQVLMS		GSPLELNSLG
EEQRILNRSK		RGWVWNQMFV		LEEFSGPEPI		LVGRLHTDLD		PGSKKIKYIL
SGDGAGTIFQ		INDVTGDIHA		IKRLDREEKA		EYTLTAQAVD		WETSKPLEPP
SEFIIKVQDI		NDNAPEFLNG		PYHATVPEMS		ILGTSVTNVT		ATDADDPVYG
NSAKLVYSIL		EGQPYFSIEP		ETAIIKTALP		NMDREAKEEY		LVVIQAKDMG
GHSGGLSGTT		TLTVTLTDVN		DNPPKFAQSL		YHFSVPEDVV		LGTAIGRVKA
NDQDIGENAQ		SSYDIIDGDG		TALFEITSDA		QAQDGIIRLR		KPLDFETKKS
YTLKVEAANV		HIDPRFSGRG		PFKDTATVKI		VVEDADEPPV		FSSPTYLLEV
HENAALNSVI		GQVTARDPDI		TSSPIRFSID		RHTDLERQFN		INADDGKITL
ATPLDRELSV		WHNITIIATE		IRNHSQISRV		PVAIKVLDVN		DNAPEFASEY
EAFLCENGKP		GQVIQTVSAM		DKDDPKNGHY		FLYSLLPEMV		NNPNFTIKKN
EDNSLSILAK		HNGFNRQKQE		VYLLPIIISD		SGNPPLSSTS		TLTIRVCGCS
NDGVVQSCNV		EAYVLPIGLS		MGALIAILAC		IILLLVIVVL		FVTLRRHKNE
PLIIKDDEDV		RENIIRYDDE		GGGEEDTEAF		DIATLQNPDG		INGFLPRKDI
KPDLQFMPRQ		GLAPVPNGVD		VDEFINVRLH		EADNDPTAPP		YDSIQIYGYE
GRGSVAGSLS		SLESTTSDSD		QNFDYLSDWG		PRFKRLGELY		SVGESDKET

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins. Biochem. J. 349: 159—167. PMID 10861224 DOI:10.1042/0264-6021:3490159
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tanihara H., Sano K., Heimark R.L., St John T., Suzuki S. (1994). Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin. Cell Adhes. Commun. 2: 15—26. PMID 7982033
• Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658

Див. також

• Хромосома 16