CDHR2

CDHR2
Ідентифікатори
Символи	CDHR2, PCDH24, PCLKC, cadherin related family member 2, PCLCK
Зовнішні ІД	MGI: 2687323 HomoloGene: 134510 GeneCards: CDHR2
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cell adhesion molecule binding Клітинна компонента • integral component of membrane • spanning component of plasma membrane • brush border membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • екзосома • apical plasma membrane • brush border • мембрана • cell projection • microvillus membrane Біологічний процес • адгезія клітин • epithelial cell differentiation • regulation of microvillus length • negative regulation of cell growth involved in contact inhibition • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • intermicrovillar adhesion • диференціація клітин • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54825	268663
Ensembl	ENSG00000074276	ENSMUSG00000034918
UniProt	Q9BYE9	E9Q7P9
RefSeq (мРНК)	NM_001171976 NM_017675	NM_001033364
RefSeq (білок)	NP_001165447 NP_060145	NP_001028536
Локус (UCSC)	Хр. 5: 176.54 – 176.6 Mb	Хр. 13: 54.85 – 54.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDHR2 (англ. Cadherin related family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 310 амінокислот, а молекулярна маса — 141 543.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQLWLSCFL		LPALVVSVAA		NVAPKFLANM		TSVILPEDLP		VGAQAFWLVA
EDQDNDPLTY		GMSGPNAYFF		AVTPKTGEVK		LASALDYETL		YTFKVTISVS
DPYIQVQREM		LVIVEDRNDN		APVFQNTAFS		TSINETLPVG		SVVFSVLAVD
KDMGSAGMVV		YSIEKVIPST		GDSEHLFRIL		ANGSIVLNGS		LSYNNKSAFY
QLELKACDLG		GMYHNTFTIQ		CSLPVFLSIS		VVDQPDLDPQ		FVREFYSASV
AEDAAKGTSV		LTVEAVDGDK		GINDPVIYSI		SYSTRPGWFD		IGADGVIRVN
GSLDREQLLE		ADEEVQLQVT		ATETHLNIYG		QEAKVSIWVT		VRVMDVNDHK
PEFYNCSLPA		CTFTPEEAQV		NFTGYVDEHA		SPRIPIDDLT		MVVYDPDKGS
NGTFLLSLGG		PDAEAFSVSP		ERAVGSASVQ		VLVRVSALVD		YERQTAMAVQ
VVATDSVSQN		FSVAMVTIHL		RDINDHRPTF		PQSLYVLTVP		EHSATGSVVT
DSIHATDPDT		GAWGQITYSL		LPGNGADLFQ		VDPVSGTVTV		RNGELLDRES
QAVYYLTLQA		TDGGNLSSST		TLQIHLLDIN		DNAPVVSGSY		NIFVQEEEGN
VSVTIQAHDN		DEPGTNNSRL		LFNLLPGPYS		HNFSLDPDTG		LLRNLGPLDR
EAIDPALEGR		IVLTVLVSDC		GEPVLGTKVN		VTITVEDIND		NLPIFNQSSY
NFTVKEEDPG		VLVGVVKAWD		ADQTEANNRI		SFSLSGSGAN		YFMIRGLVLG
AGWAEGYLRL		PPDVSLDYET		QPVFNLTVSA		ENPDPQGGET		IVDVCVNVKD
VNDNPPTLDV		ASLRGIRVAE		NGSQHGQVAV		VVASDVDTSA		QLEIQLVNIL
CTKAGVDVGS		LCWGWFSVAA		NGSVYINQSK		AIDYEACDLV		TLVVRACDLA
TDPGFQAYSN		NGSLLITIED		VNDNAPYFLP		ENKTFVIIPE		LVLPNREVAS
VRARDDDSGN		NGVILFSILR		VDFISKDGAT		IPFQGVFSIF		TSSEADVFAG
SIQPVTSLDS		TLQGTYQVTV		QARDRPSLGP		FLEATTTLNL		FTVDQSYRSR
LQFSTPKEEV		GANRQAINAA		LTQATRTTVY		IVDIQDIDSA		ARARPHSYLD
AYFVFPNGSA		LTLDELSVMI		RNDQDSLTQL		LQLGLVVLGS		QESQESDLSK
QLISVIIGLG		VALLLVLVIM		TMAFVCVRKS		YNRKLQAMKA		AKEARKTAAG
VMPSAPAIPG		TNMYNTERAN		PMLNLPNKDL		GLEYLSPSND		LDSVSVNSLD
DNSVDVDKNS		QEIKEHRPPH		TPPEPDPEPL		SVVLLGRQAG		ASGQLEGPSY
TNAGLDTTDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, диференціація клітин, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

• Okazaki N., Takahashi N., Kojima S., Masuho Y., Koga H. (2002). Protocadherin LKC, a new candidate for a tumor suppressor of colon and liver cancers, its association with contact inhibition of cell proliferation. Carcinogenesis. 23: 1139—1148. PMID 12117771 DOI:10.1093/carcin/23.7.1139
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yang L.Y., Wang W., Peng J.X., Yang J.Q., Huang G.W. (2004). Differentially expressed genes between solitary large hepatocellular carcinoma and nodular hepatocellular carcinoma. World J. Gastroenterol. 10: 3569—3573. PMID 15534908 DOI:10.3748/wjg.v10.i24.3569
• Li J., He Y., Lu Q., Zhang M. (2016). Mechanistic basis of organization of the Harmonin/USH1C-mediated brush border microvilli tip-link complex. Dev. Cell. 36: 179—189. PMID 26812017 DOI:10.1016/j.devcel.2015.12.020
• Crawley S.W., Weck M.L., Grega-Larson N.E., Shifrin D.A. Jr., Tyska M.J. (2016). ANKS4B is essential for intermicrovillar adhesion complex formation. Dev. Cell. 36: 190—200. PMID 26812018 DOI:10.1016/j.devcel.2015.12.022

Див. також

• Хромосома 5