CFAP36

CFAP36
Ідентифікатори
Символи	CFAP36, CCDC104, BARTL1, cilia and flagella associated protein 36
Зовнішні ІД	MGI: 1913994 HomoloGene: 41646 GeneCards: CFAP36
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein N-terminus binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • cell projection • ciliary transition zone • ciliary base • motile cilium • війка Біологічний процес • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	112942	216618
Ensembl	ENSG00000163001	ENSMUSG00000020462
UniProt	Q96G28	Q8C6E0
RefSeq (мРНК)	NM_001282761 NM_080667	NM_025740
RefSeq (білок)	NP_001269690 NP_542398	NP_080016
Локус (UCSC)	Хр. 2: 55.52 – 55.55 Mb	Хр. 11: 29.17 – 29.2 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CFAP36 (англ. Cilia and flagella associated protein 36) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 342 амінокислот, а молекулярна маса — 39 447.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAEEEDEVE		WVVESIAGFL		RGPDWSIPIL		DFVEQKCEVF		DDEEESKLTY
TEIHQEYKEL		VEKLLEGYLK		EIGINEDQFQ		EACTSPLAKT		HTSQAILQPV
LAAEDFTIFK		AMMVQKNIEM		QLQAIRIIQE		RNGVLPDCLT		DGSDVVSDLE
HEEMKILREV		LRKSKEEYDQ		EEERKRKKQL		SEAKTEEPTV		HSSEAAIMNN
SQGDGEHFAH		PPSEVKMHFA		NQSIEPLGRK		VERSETSSLP		QKDLKIPGLE
HASIEGPIAN		LSVLGTEELR		QREHYLKQKR		DKLMSMRKDM		RTKQIQNMEQ
KGKPTGEVEE		MTEKPEMTAE		EKQTLLKRRL		LAEKLKEEVI		NK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Totland C., Bredholt G., Haugen M., Haukanes B.I., Vedeler C.A. (2010). Antibody to CCDC104 is associated with a paraneoplastic antibody to CDR2 (anti-Yo). Cancer Immunol. Immunother. 59: 231—237. PMID 19680650 DOI:10.1007/s00262-009-0742-3

Див. також

• Хромосома 2