CHMP6

CHMP6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2K3W, 3HTU
Ідентифікатори
Символи	CHMP6, VPS20, charged multivesicular body protein 6
Зовнішні ІД	OMIM: 610901 MGI: 3583942 HomoloGene: 11607 GeneCards: CHMP6
Онтологія гена Молекулярна функція • protein N-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • ESCRT III complex • гіалоплазма • ендосома • мембрана • late endosome membrane • endosome membrane • екзосома • система ендомембран Біологічний процес • GO:0019067 viral life cycle • nucleus organization • regulation of exosomal secretion • multivesicular body assembly • ESCRT III complex assembly • endosomal transport • protein transport • septum digestion after cytokinesis • mitotic metaphase plate congression • vacuolar transport • macroautophagy • negative regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity • GO:0015915 транспорт • GO:1903362 regulation of protein catabolic process • midbody abscission Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79643	208092
Ensembl	ENSG00000176108	ENSMUSG00000025371
UniProt	Q96FZ7	P0C0A3
RefSeq (мРНК)	NM_024591	NM_001085498
RefSeq (білок)	NP_078867	NP_001078967
Локус (UCSC)	Хр. 17: 80.99 – 81.01 Mb	Хр. 11: 119.8 – 119.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHMP6 (англ. Charged multivesicular body protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 201 амінокислот, а молекулярна маса — 23 485.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGNLFGRKKQ		SRVTEQDKAI		LQLKQQRDKL		RQYQKRIAQQ		LERERALARQ
LLRDGRKERA		KLLLKKKRYQ		EQLLDRTENQ		ISSLEAMVQS		IEFTQIEMKV
MEGLQFGNEC		LNKMHQVMSI		EEVERILDET		QEAVEYQRQI		DELLAGSFTQ
EDEDAILEEL		SAITQEQIEL		PEVPSEPLPE		KIPENVPVKA		RPRQAELVAA
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

• Peck J.W., Bowden E.T., Burbelo P.D. (2004). Structure and function of human Vps20 and Snf7 proteins. Biochem. J. 377: 693—700. PMID 14583093 DOI:10.1042/BJ20031347
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
• Shim S., Kimpler L.A., Hanson P.I. (2007). Structure/function analysis of four core ESCRT-III proteins reveals common regulatory role for extreme C-terminal domain. Traffic. 8: 1068—1079. PMID 17547705 DOI:10.1111/j.1600-0854.2007.00584.x
• Kuang Z., Seo E.J., Leis J. (2011). Mechanism of inhibition of retrovirus release from cells by interferon-induced gene ISG15. J. Virol. 85: 7153—7161. PMID 21543490 DOI:10.1128/JVI.02610-10
• Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 152845—152845. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Див. також

• Хромосома 17