CHODL

CHODL
Ідентифікатори
Символи	CHODL, C21orf68, MT75, PRED12, chondrolectin
Зовнішні ІД	OMIM: 607247 MGI: 2179069 HomoloGene: 11795 GeneCards: CHODL
Пов'язані генетичні захворювання
бічний аміотрофічний склероз
Онтологія гена Молекулярна функція • hyaluronic acid binding • carbohydrate binding Клітинна компонента • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • integral component of membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum membrane Біологічний процес • muscle organ development • regulation of neuron projection development • нейробіологія розвитку • positive regulation of axonogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	140578	246048
Ensembl	ENSG00000154645	ENSMUSG00000022860
UniProt	Q9H9P2	Q9CXM0
RefSeq (мРНК)	NM_001204174 NM_001204175 NM_001204176 NM_001204177 NM_001204178 NM_024944	NM_139134 NM_001362555
RefSeq (білок)	NP_001191103 NP_001191104 NP_001191105 NP_001191106 NP_001191107 NP_079220	NP_624360 NP_001349484
Локус (UCSC)	Хр. 21: 17.9 – 18.27 Mb	Хр. 16: 78.73 – 78.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHODL (англ. Chondrolectin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 30 431.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRVVSLLLG		AALLCGHGAF		CRRVVSGQKV		CFADFKHPCY		KMAYFHELSS
RVSFQEARLA		CESEGGVLLS		LENEAEQKLI		ESMLQNLTKP		GTGISDGDFW
IGLWRNGDGQ		TSGACPDLYQ		WSDGSNSQYR		NWYTDEPSCG		SEKCVVMYHQ
PTANPGLGGP		YLYQWNDDRC		NMKHNYICKY		EPEINPTAPV		EKPYLTNQPG
DTHQNVVVTE		AGIIPNLIYV		VIPTIPLLLL		ILVAFGTCCF		QMLHKSKGRT
KTSPNQSTLW		ISKSTRKESG		MEV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Weng L., Smits P., Wauters J., Merregaert J. (2002). Molecular cloning and characterization of human chondrolectin, a novel type I transmembrane protein homologous to C-type lectins. Genomics. 80: 62—70. PMID 12079284 DOI:10.1006/geno.2002.6806
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 21