CHORDC1

CHORDC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YRT
Ідентифікатори
Символи	CHORDC1, CHP1, cysteine and histidine rich domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604353 MGI: 1914167 HomoloGene: 8111 GeneCards: CHORDC1
Онтологія гена Молекулярна функція • Hsp90 protein binding • ADP binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • компонент клітини Біологічний процес • regulation of cellular response to heat • regulation of centrosome duplication • negative regulation of Rho-dependent protein serine/threonine kinase activity • chaperone-mediated protein folding Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26973	66917
Ensembl	ENSG00000110172 ENSG00000285023	ENSMUSG00000001774
UniProt	Q9UHD1	Q9D1P4
RefSeq (мРНК)	NM_001144073 NM_012124	NM_025844
RefSeq (білок)	NP_001137545 NP_036256	NP_080120
Локус (UCSC)	Хр. 11: 90.2 – 90.22 Mb	Хр. 9: 18.2 – 18.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHORDC1 (англ. Cysteine and histidine rich domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 332 амінокислот, а молекулярна маса — 37 490.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALLCYNRGC		GQRFDPETNS		DDACTYHPGV		PVFHDALKGW		SCCKRRTTDF
SDFLSIVGCT		KGRHNSEKPP		EPVKPEVKTT		EKKELCELKP		KFQEHIIQAP
KPVEAIKRPS		PDEPMTNLEL		KISASLKQAL		DKLKLSSGNE		ENKKEEDNDE
IKIGTSCKNG		GCSKTYQGLE		SLEEVCVYHS		GVPIFHEGMK		YWSCCRRKTS
DFNTFLAQEG		CTKGKHMWTK		KDAGKKVVPC		RHDWHQTGGE		VTISVYAKNS
LPELSRVEAN		STLLNVHIVF		EGEKEFDQNV		KLWGVIDVKR		SYVTMTATKI
EITMRKAEPM		QWASLELPAA		KKQEKQKDAT		TD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на стрес, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gano J.J., Simon J.A. (2010). A proteomic investigation of ligand-dependent HSP90 complexes reveals CHORDC1 as a novel ADP-dependent HSP90-interacting protein. Mol. Cell. Proteomics. 9: 255—270. PMID 19875381 DOI:10.1074/mcp.M900261-MCP200

Див. також

• Хромосома 11