CHPF

CHPF
Ідентифікатори
Символи	CHPF, CHSY2, CSS2, chondroitin polymerizing factor
Зовнішні ІД	OMIM: 610405 MGI: 106576 HomoloGene: 11574 GeneCards: CHPF
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • acetylgalactosaminyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • glycosyltransferase activity • N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase activity • glucuronosyl-N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 4-beta-N-acetylgalactosaminyltransferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • Golgi cisterna membrane • гіалоплазма • Golgi membrane • мітохондріальний матрикс • комплекс Ґольджі • мітохондрія • мембрана Біологічний процес • chondroitin sulfate biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79586	74241
Ensembl	ENSG00000123989	ENSMUSG00000032997
UniProt	Q8IZ52	Q6IQX7
RefSeq (мРНК)	NM_001195731 NM_024536	NM_001001565 NM_001001566
RefSeq (білок)	NP_001182660 NP_078812	NP_001001565 NP_001001566
Локус (UCSC)	Хр. 2: 219.54 – 219.54 Mb	Хр. 1: 75.45 – 75.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHPF (англ. Chondroitin polymerizing factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 775 амінокислот, а молекулярна маса — 85 467.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRASLLLSVL		RPAGPVAVGI		SLGFTLSLLS		VTWVEEPCGP		GPPQPGDSEL
PPRGNTNAAR		RPNSVQPGAE		REKPGAGEGA		GENWEPRVLP		YHPAQPGQAA
KKAVRTRYIS		TELGIRQRLL		VAVLTSQTTL		PTLGVAVNRT		LGHRLERVVF
LTGARGRRAP		PGMAVVTLGE		ERPIGHLHLA		LRHLLEQHGD		DFDWFFLVPD
TTYTEAHGLA		RLTGHLSLAS		AAHLYLGRPQ		DFIGGEPTPG		RYCHGGFGVL
LSRMLLQQLR		PHLEGCRNDI		VSARPDEWLG		RCILDATGVG		CTGDHEGVHY
SHLELSPGEP		VQEGDPHFRS		ALTAHPVRDP		VHMYQLHKAF		ARAELERTYQ
EIQELQWEIQ		NTSHLAVDGD		QAAAWPVGIP		APSRPASRFE		VLRWDYFTEQ
HAFSCADGSP		RCPLRGADRA		DVADVLGTAL		EELNRRYHPA		LRLQKQQLVN
GYRRFDPARG		MEYTLDLQLE		ALTPQGGRRP		LTRRVQLLRP		LSRVEILPVP
YVTEASRLTV		LLPLAAAERD		LAPGFLEAFA		TAALEPGDAA		AALTLLLLYE
PRQAQRVAHA		DVFAPVKAHV		AELERRFPGA		RVPWLSVQTA		APSPLRLMDL
LSKKHPLDTL		FLLAGPDTVL		TPDFLNRCRM		HAISGWQAFF		PMHFQAFHPA
VAPPQGPGPP		ELGRDTGRFD		RQAASEACFY		NSDYVAARGR		LAAASEQEEE
LLESLDVYEL		FLHFSSLHVL		RAVEPALLQR		YRAQTCSARL		SEDLYHRCLQ
SVLEGLGSRT		QLAMLLFEQE		QGNST

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, мітохондрії, апараті гольджі.

Література

• Kitagawa H., Izumikawa T., Uyama T., Sugahara K. (2003). Molecular cloning of a chondroitin polymerizing factor that cooperates with chondroitin synthase for chondroitin polymerization. J. Biol. Chem. 278: 23666—23671. PMID 12716890 DOI:10.1074/jbc.M302493200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2