CHST6

CHST6
Ідентифікатори
Символи	CHST6, MCDC1, carbohydrate sulfotransferase 6, GST4-beta, gn6st-5, hCGn6ST, glcNAc6ST-5, C-GlcNAc6ST
Зовнішні ІД	OMIM: 605294 MGI: 1931825 HomoloGene: 56927 GeneCards: CHST6
Онтологія гена Молекулярна функція • sulfotransferase activity • transferase activity • N-acetylglucosamine 6-O-sulfotransferase activity Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • Golgi membrane • мембрана • integral component of membrane • trans-Golgi network Біологічний процес • sulfur compound metabolic process • keratan sulfate biosynthetic process • N-acetylglucosamine metabolic process • carbohydrate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4166	56773
Ensembl	ENSG00000183196	ENSMUSG00000031952
UniProt	Q9GZX3	Q9QUP4
RefSeq (мРНК)	NM_021615	NM_019950
RefSeq (білок)	NP_067628	NP_064334
Локус (UCSC)	Хр. 16: 75.47 – 75.5 Mb	Хр. 8: 112.62 – 112.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHST6 (англ. Carbohydrate sulfotransferase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 395 амінокислот, а молекулярна маса — 44 099.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWLPRVSSTA		VTALLLAQTF		LLLFLVSRPG		PSSPAGGEAR		VHVLVLSSWR
SGSSFVGQLF		NQHPDVFYLM		EPAWHVWTTL		SQGSAATLHM		AVRDLVRSVF
LCDMDVFDAY		LPWRRNLSDL		FQWAVSRALC		SPPACSAFPR		GAISSEAVCK
PLCARQSFTL		AREACRSYSH		VVLKEVRFFN		LQVLYPLLSD		PALNLRIVHL
VRDPRAVLRS		REQTAKALAR		DNGIVLGTNG		TWVEADPGLR		VVREVCRSHV
RIAEAATLKP		PPFLRGRYRL		VRFEDLAREP		LAEIRALYAF		TGLSLTPQLE
AWIHNITHGS		GPGARREAFK		TSSRNALNVS		QAWRHALPFA		KIRRVQELCA
GALQLLGYRP		VYSEDEQRNL		ALDLVLPRGL		NGFTWASSTA		SHPRN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як вуглеводний обмін. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bartes A., Bhakta S., Hemmerich S. (2001). Sulfation of endothelial mucin by corneal keratan N-acetylglucosamine 6-O-sulfotransferase (GST-4beta). Biochem. Biophys. Res. Commun. 282: 928—933. PMID 11352640 DOI:10.1006/bbrc.2001.4668
• Akama T.O., Misra A.K., Hindsgaul O., Fukuda M.N. (2002). Enzymatic synthesis in vitro of the disulfated disaccharide unit of corneal keratan sulfate. J. Biol. Chem. 277: 42505—42513. PMID 12218059 DOI:10.1074/jbc.M207412200
• Abbruzzese C., Kuhn U., Molina F., Rama P., De Luca M. (2004). Novel mutations in the CHST6 gene causing macular corneal dystrophy. Clin. Genet. 65: 120—125. PMID 14984470 DOI:10.1111/j.0009-9163.2004.00191.x
• Lee Y.K., Chang D.J., Chung S.K. (2013). A case of Korean patient with macular corneal dystrophy associated with novel mutation in the CHST6 gene. Korean J. Ophthalmol. 27: 454—458. PMID 24311932 DOI:10.3341/kjo.2013.27.6.454

Див. також

• Хромосома 16