CILP

CILP
Ідентифікатори
Символи	CILP, CILP-1, HsT18872, cartilage intermediate layer protein
Зовнішні ІД	OMIM: 603489 MGI: 2444507 HomoloGene: 2679 GeneCards: CILP
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide diphosphatase activity • alkaline phosphatase activity • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця • екзосома • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • negative regulation of insulin-like growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of gene expression • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • negative regulation of SMAD protein signal transduction • cellular response to transforming growth factor beta stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8483	214425
Ensembl	ENSG00000138615	ENSMUSG00000042254
UniProt	O75339	Q66K08
RefSeq (мРНК)	NM_003613	NM_173385 NM_001364527
RefSeq (білок)	NP_003604	NP_775561 NP_001351456
Локус (UCSC)	Хр. 15: 65.19 – 65.21 Mb	Хр. 9: 65.17 – 65.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CILP (англ. Cartilage intermediate layer protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 184 амінокислот, а молекулярна маса — 132 565.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVGTKAWVFS		FLVLEVTSVL		GRQTMLTQSV		RRVQPGKKNP		SIFAKPADTL
ESPGEWTTWF		NIDYPGGKGD		YERLDAIRFY		YGDRVCARPL		RLEARTTDWT
PAGSTGQVVH		GSPREGFWCL		NREQRPGQNC		SNYTVRFLCP		PGSLRRDTER
IWSPWSPWSK		CSAACGQTGV		QTRTRICLAE		MVSLCSEASE		EGQHCMGQDC
TACDLTCPMG		QVNADCDACM		CQDFMLHGAV		SLPGGAPASG		AAIYLLTKTP
KLLTQTDSDG		RFRIPGLCPD		GKSILKITKV		KFAPIVLTMP		KTSLKAATIK
AEFVRAETPY		MVMNPETKAR		RAGQSVSLCC		KATGKPRPDK		YFWYHNDTLL
DPSLYKHESK		LVLRKLQQHQ		AGEYFCKAQS		DAGAVKSKVA		QLIVIASDET
PCNPVPESYL		IRLPHDCFQN		ATNSFYYDVG		RCPVKTCAGQ		QDNGIRCRDA
VQNCCGISKT		EEREIQCSGY		TLPTKVAKEC		SCQRCTETRS		IVRGRVSAAD
NGEPMRFGHV		YMGNSRVSMT		GYKGTFTLHV		PQDTERLVLT		FVDRLQKFVN
TTKVLPFNKK		GSAVFHEIKM		LRRKKPITLE		AMETNIIPLG		EVVGEDPMAE
LEIPSRSFYR		QNGEPYIGKV		KASVTFLDPR		NISTATAAQT		DLNFINDEGD
TFPLRTYGMF		SVDFRDEVTS		EPLNAGKVKV		HLDSTQVKMP		EHISTVKLWS
LNPDTGLWEE		EGDFKFENQR		RNKREDRTFL		VGNLEIRERR		LFNLDVPESR
RCFVKVRAYR		SERFLPSEQI		QGVVISVINL		EPRTGFLSNP		RAWGRFDSVI
TGPNGACVPA		FCDDQSPDAY		SAYVLASLAG		EELQAVESSP		KFNPNAIGVP
QPYLNKLNYR		RTDHEDPRVK		KTAFQISMAK		PRPNSAEESN		GPIYAFENLR
ACEEAPPSAA		HFRFYQIEGD		RYDYNTVPFN		EDDPMSWTED		YLAWWPKPME
FRACYIKVKI		VGPLEVNVRS		RNMGGTHRQT		VGKLYGIRDV		RSTRDRDQPN
VSAACLEFKC		SGMLYDQDRV		DRTLVKVIPQ		GSCRRASVNP		MLHEYLVNHL
PLAVNNDTSE		YTMLAPLDPL		GHNYGIYTVT		DQDPRTAKEI		ALGRCFDGTS
DGSSRIMKSN		VGVALTFNCV		ERQVGRQSAF		QYLQSTPAQS		PAAGTVQGRV
PSRRQQRASR		GGQRQGGVVA		SLRFPRVAQQ		PLIN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Lorenzo P., Neame P., Sommarin Y., Heinegaerd D. (1998). Cloning and deduced amino acid sequence of a novel cartilage protein (CILP) identifies a proform including a nucleotide pyrophosphohydrolase. J. Biol. Chem. 273: 23469—23475. PMID 9722584 DOI:10.1074/jbc.273.36.23469
• Nakamura I., Okawa A., Ikegawa S., Takaoka K., Nakamura Y. (1999). Genomic organization, mapping, and polymorphisms of the gene encoding human cartilage intermediate layer protein (CILP). J. Hum. Genet. 44: 203—205. PMID 10319588 DOI:10.1007/s100380050143
• Lorenzo P., Aman P., Sommarin Y., Heinegaerd D. (1999). The human CILP gene: exon/intron organization and chromosomal mapping. Matrix Biol. 18: 445—454. PMID 10601732 DOI:10.1016/S0945-053X(99)00035-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lorenzo P., Bayliss M.T., Heinegaerd D. (1998). A novel cartilage protein (CILP) present in the mid-zone of human articular cartilage increases with age. J. Biol. Chem. 273: 23463—23468. PMID 9722583 DOI:10.1074/jbc.273.36.23463
• Hirose J., Ryan L.M., Masuda I. (2002). Up-regulated expression of cartilage intermediate-layer protein and ANK in articular hyaline cartilage from patients with calcium pyrophosphate dihydrate crystal deposition disease. Arthritis Rheum. 46: 3218—3229. PMID 12483726 DOI:10.1002/art.10632

Див. також

• Хромосома 15