CKAP5

CKAP5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4QMI, 4QMJ
Ідентифікатори
Символи	CKAP5, CHTOG, MSPS, TOG, TOGp, ch-TOG, cytoskeleton associated protein 5
Зовнішні ІД	OMIM: 611142 MGI: 1923036 HomoloGene: 8844 GeneCards: CKAP5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding • microtubule plus-end binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • центросома • spindle pole • мембрана • microtubule cytoskeleton • gamma-tubulin complex • центр організації мікротрубочок • microtubule plus-end • цитоскелет • центромера • кінетохор • хромосома • веретено поділу • ядерце • клітинна мембрана • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • RNA transport • establishment or maintenance of microtubule cytoskeleton polarity • поділ клітини • GO:0043146 spindle organization • G2/M transition of mitotic cell cycle • клітинний цикл • sister chromatid cohesion • centrosome cycle • microtubule polymerization • centrosome duplication • ciliary basal body-plasma membrane docking • regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • microtubule depolymerization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9793	75786
Ensembl	ENSG00000175216	ENSMUSG00000040549
UniProt	Q14008	A2AGT5
RefSeq (мРНК)	NM_014756 NM_001008938	NM_001165989 NM_029437
RefSeq (білок)	NP_001008938 NP_055571	NP_001159461 NP_083713
Локус (UCSC)	Хр. 11: 46.74 – 46.85 Mb	Хр. 2: 91.36 – 91.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CKAP5 (англ. Cytoskeleton associated protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 032 амінокислот, а молекулярна маса — 225 495.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDDSEWLKL		PVDQKCEHKL		WKARLSGYEE		ALKIFQKIKD		EKSPEWSKFL
GLIKKFVTDS		NAVVQLKGLE		AALVYVENAH		VAGKTTGEVV		SGVVSKVFNQ
PKAKAKELGI		EICLMYIEIE		KGEAVQEELL		KGLDNKNPKI		IVACIETLRK
ALSEFGSKII		LLKPIIKVLP		KLFESREKAV		RDEAKLIAVE		IYRWIRDALR
PPLQNINSVQ		LKELEEEWVK		LPTSAPRPTR		FLRSQQELEA		KLEQQQSAGG
DAEGGGDDGD		EVPQIDAYEL		LEAVEILSKL		PKDFYDKIEA		KKWQERKEAL
ESVEVLIKNP		KLEAGDYADL		VKALKKVVGK		DTNVMLVALA		AKCLTGLAVG
LRKKFGQYAG		HVVPTILEKF		KEKKPQVVQA		LQEAIDAIFL		TTTLQNISED
VLAVMDNKNP		TIKQQTSLFI		ARSFRHCTAS		TLPKSLLKPF		CAALLKHIND
SAPEVRDAAF		EALGTALKVV		GEKAVNPFLA		DVDKLKLDKI		KECSEKVELI
HGKKAGLAAD		KKEFKPLPGR		TAASGAAGDK		DTKDISAPKP		GPLKKAPAAK
AGGPPKKGKP		AAPGGAGNTG		TKNKKGLETK		EIVEPELSIE		VCEEKASAVL
PPTCIQLLDS		SNWKERLACM		EEFQKAVELM		DRTEMPCQAL		VRMLAKKPGW
KETNFQVMQM		KLHIVALIAQ		KGNFSKTSAQ		VVLDGLVDKI		GDVKCGNNAK
EAMTAIAEAC		MLPWTAEQVV		SMAFSQKNPK		NQSETLNWLS		NAIKEFGFSG
LNVKAFISNV		KTALAATNPA		VRTAAITLLG		VMYLYVGPSL		RMFFEDEKPA
LLSQIDAEFE		KMQGQSPPAP		TRGISKHSTS		GTDEGEDGDE		PDDGSNDVVD
LLPRTEISDK		ITSELVSKIG		DKNWKIRKEG		LDEVAGIIND		AKFIQPNIGE
LPTALKGRLN		DSNKILVQQT		LNILQQLAVA		MGPNIKQHVK		NLGIPIITVL
GDSKNNVRAA		ALATVNAWAE		QTGMKEWLEG		EDLSEELKKE		NPFLRQELLG
WLAEKLPTLR		STPTDLILCV		PHLYSCLEDR		NGDVRKKAQD		ALPFFMMHLG
YEKMAKATGK		LKPTSKDQVL		AMLEKAKVNM		PAKPAPPTKA		TSKPMGGSAP
AKFQPASAPA		EDCISSSTEP		KPDPKKAKAP		GLSSKAKSAQ		GKKMPSKTSL
KEDEDKSGPI		FIVVPNGKEQ		RMKDEKGLKV		LKWNFTTPRD		EYIEQLKTQM
SSCVAKWLQD		EMFHSDFQHH		NKALAVMVDH		LESEKEGVIG		CLDLILKWLT
LRFFDTNTSV		LMKALEYLKL		LFTLLSEEEY		HLTENEASSF		IPYLVVKVGE
PKDVIRKDVR		AILNRMCLVY		PASKMFPFIM		EGTKSKNSKQ		RAECLEELGC
LVESYGMNVC		QPTPGKALKE		IAVHIGDRDN		AVRNAALNTI		VTVYNVHGDQ
VFKLIGNLSE		KDMSMLEERI		KRSAKRPSAA		PIKQVEEKPQ		RAQNISSNAN
MLRKGPAEDM		SSKLNQARSM		SGHPEAAQMV		RREFQLDLDE		IENDNGTVRC
EMPELVQHKL		DDIFEPVLIP		EPKIRAVSPH		FDDMHSNTAS		TINFIISQVA
SGDINTSIQA		LTQIDEVLRQ		EDKAEAMSGH		IDQFLIATFM		QLRLIYNTHM
ADEKLEKDEI		IKLYSCIIGN		MISLFQIESL		AREASTGVLK		DLMHGLITLM
LDSRIEDLEE		GQQVIRSVNL		LVVKVLEKSD		QTNILSALLV		LLQDSLLATA
SSPKFSELVM		KCLWRMVRLL		PDTINSINLD		RILLDIHIFM		KVFPKEKLKQ
CKSEFPIRTL		KTLLHTLCKL		KGPKILDHLT		MIDNKNESEL		EAHLCRMMKH
SMDQTGSKSD		KETEKGASRI		DEKSSKAKVN		DFLAEIFKKI		GSKENTKEGL
AELYEYKKKY		SDADIEPFLK		NSSQFFQSYV		ERGLRVIEME		REGKGRISTS
TGISPQMEVT		CVPTPTSTVS		SIGNTNGEEV		GPSVYLERLK		ILRQRCGLDN
TKQDDRPPLT		SLLSKPAVPT		VASSTDMLHS		KLSQLRESRE		QHQHSDLDSN
QTHSSGTVTS		SSSTANIDDL		KKRLERIKSS		RK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, хромосомах, центромерах, кінетохорі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Charrasse S., Coubes P., Arrancibia S., Larroque C. (1996). Expression of the tumor over-expressed ch-TOG gene in human and baboon brain. Neurosci. Lett. 212: 119—122. PMID 8832653 DOI:10.1016/0304-3940(96)12789-0
• Lauffart B., Howell S.J., Tasch J.E., Cowell J.K., Still I.H. (2002). Interaction of the transforming acidic coiled-coil 1 (TACC1) protein with ch-TOG and GAS41/NuBI1 suggests multiple TACC1-containing protein complexes in human cells. Biochem. J. 363: 195—200. PMID 11903063 DOI:10.1042/0264-6021:3630195
• Gergely F., Draviam V.M., Raff J.W. (2003). The ch-TOG/XMAP215 protein is essential for spindle pole organization in human somatic cells. Genes Dev. 17: 336—341. PMID 12569123 DOI:10.1101/gad.245603
• Kosturko L.D., Maggipinto M.J., D'Sa C., Carson J.H., Barbarese E. (2005). The microtubule-associated protein tumor overexpressed gene binds to the RNA trafficking protein heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2. Mol. Biol. Cell. 16: 1938—1947. PMID 15703215 DOI:10.1091/mbc.E04-08-0709
• Barr A.R., Gergely F. (2008). MCAK-independent functions of ch-Tog/XMAP215 in microtubule plus-end dynamics. Mol. Cell. Biol. 28: 7199—7211. PMID 18809577 DOI:10.1128/MCB.01040-08

Див. також

• Хромосома 11