CLDN18

CLDN18
Ідентифікатори
Символи	CLDN18, SFTA5, SFTPJ, claudin 18
Зовнішні ІД	OMIM: 609210 MGI: 1929209 HomoloGene: 9489 GeneCards: CLDN18
Онтологія гена Молекулярна функція • structural molecule activity • identical protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • мембрана • bicellular tight junction Біологічний процес • negative regulation of protein localization to nucleus • TNFSF11-mediated signaling pathway • calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules • digestive tract development • negative regulation of osteoclast development • negative regulation of bone resorption • response to ethanol Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51208	56492
Ensembl	ENSG00000066405	ENSMUSG00000032473
UniProt	P56856	P56857
RefSeq (мРНК)	NM_016369 NM_001002026	NM_001194921 NM_001194922 NM_001194923 NM_019815
RefSeq (білок)	NP_001002026 NP_057453	NP_001181850 NP_001181851 NP_001181852 NP_062789
Локус (UCSC)	Хр. 3: 138 – 138.03 Mb	Хр. 9: 99.57 – 99.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLDN18 (англ. Claudin 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 261 амінокислот, а молекулярна маса — 27 856.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSTTTCQVVA		FLLSILGLAG		CIAATGMDMW		STQDLYDNPV		TSVFQYEGLW
RSCVRQSSGF		TECRPYFTIL		GLPAMLQAVR		ALMIVGIVLG		AIGLLVSIFA
LKCIRIGSME		DSAKANMTLT		SGIMFIVSGL		CAIAGVSVFA		NMLVTNFWMS
TANMYTGMGG		MVQTVQTRYT		FGAALFVGWV		AGGLTLIGGV		MMCIACRGLA
PEETNYKAVS		YHASGHSVAY		KPGGFKASTG		FGSNTKNKKI		YDGGARTEDE
VQSYPSKHDY		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3