CLDN5

CLDN5
Ідентифікатори
Символи	CLDN5, AWAL, BEC1, CPETRL1, TMVCF, claudin 5, TMDVCF
Зовнішні ІД	OMIM: 602101 MGI: 1276112 HomoloGene: 2459 GeneCards: CLDN5
Онтологія гена Молекулярна функція • structural molecule activity • identical protein binding Клітинна компонента • мембрана • apicolateral plasma membrane • cortical actin cytoskeleton • cell-cell junction • integral component of membrane • bicellular tight junction • клітинна мембрана • міжклітинні контакти Біологічний процес • cell-cell junction assembly • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • outflow tract morphogenesis • навчення • positive regulation of establishment of endothelial barrier • roof of mouth development • calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules • face morphogenesis • regulation of bicellular tight junction assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7122	12741
Ensembl	ENSG00000184113	ENSMUSG00000041378
UniProt	O00501	O54942
RefSeq (мРНК)	NM_003277 NM_001130861 NM_001363066 NM_001363067	NM_013805
RefSeq (білок)	NP_001124333 NP_003268 NP_001349995 NP_001349996	NP_038833
Локус (UCSC)	Хр. 22: 19.52 – 19.53 Mb	Хр. 16: 18.6 – 18.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLDN5 (англ. Claudin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 218 амінокислот, а молекулярна маса — 23 147.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSAALEILG		LVLCLVGWGG		LILACGLPMW		QVTAFLDHNI		VTAQTTWKGL
WMSCVVQSTG		HMQCKVYDSV		LALSTEVQAA		RALTVSAVLL		AFVALFVTLA
GAQCTTCVAP		GPAKARVALT		GGVLYLFCGL		LALVPLCWFA		NIVVREFYDP
SVPVSQKYEL		GAALYIGWAA		TALLMVGGCL		LCCGAWVCTG		RPDLSFPVKY
SAPRRPTATG		DYDKKNYV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 22