CLEC1B

CLEC1B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2C6U, 3WSR, 3WWK
Ідентифікатори
Символи	CLEC1B, 1810061I13Rik, CLEC2, CLEC2B, PRO1384, QDED721, C-type lectin domain family 1 member B
Зовнішні ІД	OMIM: 606783 MGI: 1913287 HomoloGene: 49468 GeneCards: CLEC1B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • carbohydrate binding • transmembrane signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана Біологічний процес • platelet activation • defense response • cell surface receptor signaling pathway • Тромбоцитопоез • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51266	56760
Ensembl	ENSG00000165682	ENSMUSG00000030159
UniProt	Q9P126	Q9JL99
RefSeq (мРНК)	NM_001099431 NM_016509 NM_001393342	NM_001204239 NM_001204253 NM_019985
RefSeq (білок)	NP_001092901 NP_057593	NP_001191168 NP_001191182 NP_064369
Локус (UCSC)	Хр. 12: 9.99 – 10.01 Mb	Хр. 6: 129.37 – 129.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLEC1B (англ. C-type lectin domain family 1 member B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 229 амінокислот, а молекулярна маса — 26 596.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQDEDGYITL		NIKTRKPALI		SVGSASSSWW		RVMALILLIL		CVGMVVGLVA
LGIWSVMQRN		YLQGENENRT		GTLQQLAKRF		CQYVVKQSEL		KGTFKGHKCS
PCDTNWRYYG		DSCYGFFRHN		LTWEESKQYC		TDMNATLLKI		DNRNIVEYIK
ARTHLIRWVG		LSRQKSNEVW		KWEDGSVISE		NMFEFLEDGK		GNMNCAYFHN
GKMHPTFCEN		KHYLMCERKA		GMTKVDQLP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у мембрані.

Література

• Colonna M., Samaridis J., Angman L. (2000). Molecular characterization of two novel C-type lectin-like receptors, one of which is selectively expressed in human dendritic cells. Eur. J. Immunol. 30: 697—704. PMID 10671229 DOI:10.1002/1521-4141(200002)30:2<697::AID-IMMU697>3.0.CO;2-M
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12