CLPP

CLPP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1TG6
Ідентифікатори
Символи	CLPP, PRLTS3, DFNB81, caseinolytic mitochondrial matrix peptidase proteolytic subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 601119 MGI: 1858213 HomoloGene: 4385 GeneCards: CLPP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • serine-type peptidase activity • serine-type endopeptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • identical protein binding • ATP-dependent peptidase activity • ATPase binding Клітинна компонента • мітохондріальний матрикс • мітохондрія • endopeptidase Clp complex Біологічний процес • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • protein homooligomerization • протеоліз • protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8192	53895
Ensembl	ENSG00000125656	ENSMUSG00000002660
UniProt	Q16740	O88696
RefSeq (мРНК)	NM_006012	NM_017393
RefSeq (білок)	NP_006003	NP_059089
Локус (UCSC)	Хр. 19: 6.36 – 6.37 Mb	Хр. 17: 57.3 – 57.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLPP (англ. Caseinolytic mitochondrial matrix peptidase proteolytic subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 277 амінокислот, а молекулярна маса — 30 180.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWPGILVGGA		RVASCRYPAL		GPRLAAHFPA		QRPPQRTLQN		GLALQRCLHA
TATRALPLIP		IVVEQTGRGE		RAYDIYSRLL		RERIVCVMGP		IDDSVASLVI
AQLLFLQSES		NKKPIHMYIN		SPGGVVTAGL		AIYDTMQYIL		NPICTWCVGQ
AASMGSLLLA		AGTPGMRHSL		PNSRIMIHQP		SGGARGQATD		IAIQAEEIMK
LKKQLYNIYA		KHTKQSLQVI		ESAMERDRYM		SPMEAQEFGI		LDKVLVHPPQ
DGEDEPTLVQ		KEPVEAAPAA		EPVPAST

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Локалізований у мітохондрії.

Література

• Bross P., Andresen B.S., Knudsen I., Kruse T.A., Gregersen N. (1995). Human ClpP protease: cDNA sequence, tissue-specific expression and chromosomal assignment of the gene. FEBS Lett. 377: 249—252. PMID 8543061 DOI:10.1016/0014-5793(95)01353-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Xu G., Shin S.B., Jaffrey S.R. (2009). Global profiling of protease cleavage sites by chemoselective labeling of protein N-termini. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106: 19310—19315. PMID 19892738 DOI:10.1073/pnas.0908958106
• Kang S.G., Dimitrova M.N., Ortega J., Ginsburg A., Maurizi M.R. (2005). Human mitochondrial ClpP is a stable heptamer that assembles into a tetradecamer in the presence of ClpX. J. Biol. Chem. 280: 35424—35432. PMID 16115876 DOI:10.1074/jbc.M507240200
• Kang S.G., Maurizi M.R., Thompson M., Mueser T., Ahvazi B. (2004). Crystallography and mutagenesis point to an essential role for the N-terminus of human mitochondrial ClpP. J. Struct. Biol. 148: 338—352. PMID 15522782 DOI:10.1016/j.jsb.2004.07.004

Див. також

• Хромосома 19